97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0598 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  682    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  58.68 
 
 		 342 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  54.49 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  58.88 
 
 		 350 aa  362  4e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  55.19 
 
 		 353 aa  345  8e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  53.37 
 
 		 343 aa  345  8.999999999999999e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  46.53 
 
 		 345 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  53.15 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  46.5 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  50.6 
 
 		 344 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  47.13 
 
 		 344 aa  332  4e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  51.67 
 
 		 342 aa  330  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  47.89 
 
 		 354 aa  329  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  51.53 
 
 		 344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  52.13 
 
 		 342 aa  325  1e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  50.61 
 
 		 342 aa  322  6e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  48.76 
 
 		 350 aa  322  7e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  49.23 
 
 		 358 aa  320  3e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  48.62 
 
 		 366 aa  318  7e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  48.63 
 
 		 340 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  48.66 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  49.36 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  48.03 
 
 		 336 aa  309  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  48.36 
 
 		 342 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  46.18 
 
 		 344 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  49.25 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  48.2 
 
 		 356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  49.51 
 
 		 365 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  44.21 
 
 		 353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  48.36 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  47.75 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  44.21 
 
 		 353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  49.69 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  47.59 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  49.26 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  47.71 
 
 		 352 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  44.61 
 
 		 351 aa  296  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  41.72 
 
 		 341 aa  295  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  48.06 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  43.62 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  47.88 
 
 		 331 aa  289  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  45.31 
 
 		 355 aa  288  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  45.31 
 
 		 355 aa  288  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  49.35 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  43.32 
 
 		 352 aa  287  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  44.34 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  51.94 
 
 		 281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  39.94 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  46.53 
 
 		 335 aa  282  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  46.44 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  42.94 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  44.89 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  44.18 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  50.83 
 
 		 256 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  44.7 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  42.51 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  42.77 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  54.51 
 
 		 242 aa  257  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  38.46 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  44.64 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  49.23 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  52.99 
 
 		 144 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  47.58 
 
 		 336 aa  135  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  46.4 
 
 		 141 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  47.69 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  43.51 
 
 		 210 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  45.24 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  45.24 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  43.65 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  42.75 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  42.75 
 
 		 197 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  47.06 
 
 		 127 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  38.19 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  38.19 
 
 		 328 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  43.51 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  41.22 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  39.86 
 
 		 332 aa  106  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  39.53 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  57.65 
 
 		 108 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  49.12 
 
 		 154 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  39.2 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  35.57 
 
 		 192 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  39.37 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  38.33 
 
 		 135 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  45.74 
 
 		 117 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  35.29 
 
 		 198 aa  90.1  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  52.63 
 
 		 105 aa  84  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  41.24 
 
 		 121 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  42.06 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  50.72 
 
 		 81 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  38.64 
 
 		 90 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  36.25 
 
 		 81 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  30.91 
 
 		 88 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.454055 
 
 
-
 
NC_002950  PG0821  putative lipoprotein  25.77 
 
 		 120 aa  42.7  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  43.75 
 
 		 77 aa  42.7  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1452  putative lipoprotein  25.77 
 
 		 120 aa  42.7  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>