57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2024 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  181  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.454055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  53.06 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  49.06 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  44 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  46.94 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  43.75 
 
 
369 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  48 
 
 
337 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  37.93 
 
 
335 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  42.86 
 
 
281 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  40 
 
 
342 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  47.06 
 
 
334 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  38.71 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  37.04 
 
 
332 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  38.6 
 
 
210 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  36.07 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  34.48 
 
 
342 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  44 
 
 
344 aa  50.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  38.89 
 
 
353 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  29.89 
 
 
354 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  38 
 
 
339 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  35.29 
 
 
334 aa  49.3  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  41.51 
 
 
330 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  35.19 
 
 
344 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  39.22 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  40 
 
 
337 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  36.54 
 
 
331 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  38 
 
 
319 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  39.22 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  38.78 
 
 
340 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  35.29 
 
 
336 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  38.3 
 
 
340 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  33.33 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  30.91 
 
 
333 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  41.07 
 
 
198 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  36.21 
 
 
341 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  36.21 
 
 
366 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  35.19 
 
 
356 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  36.17 
 
 
332 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 
291 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  38.6 
 
 
342 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  37.25 
 
 
358 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  29.82 
 
 
344 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  36.21 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  31.58 
 
 
345 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  33.96 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  28.57 
 
 
334 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  32.65 
 
 
324 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  32.65 
 
 
324 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  33.33 
 
 
352 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  30 
 
 
350 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  29.63 
 
 
334 aa  41.2  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  25.45 
 
 
256 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  32.14 
 
 
365 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  29.17 
 
 
242 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>