98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1093 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  706    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  58.68 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  58.58 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  61.64 
 
 		 342 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  63.16 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  56.84 
 
 		 352 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  59.75 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  55.15 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  55.15 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  55.38 
 
 		 344 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  54.62 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  57.55 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  54.77 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  54.05 
 
 		 340 aa  358  8e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  54.29 
 
 		 366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  50.3 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  54.37 
 
 		 342 aa  351  1e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  55.42 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  51.17 
 
 		 341 aa  346  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  52.92 
 
 		 342 aa  346  4e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  54.81 
 
 		 350 aa  345  8.999999999999999e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  51.37 
 
 		 358 aa  344  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  51.17 
 
 		 341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  54.6 
 
 		 334 aa  342  5e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  55.35 
 
 		 352 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  49.71 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  52.13 
 
 		 353 aa  338  8e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  52.24 
 
 		 344 aa  338  9e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  51.35 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  50.44 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  52.1 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  48.8 
 
 		 342 aa  329  4e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  50.31 
 
 		 336 aa  323  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  51.04 
 
 		 335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  48.81 
 
 		 356 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  48.73 
 
 		 334 aa  316  4e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  52.1 
 
 		 335 aa  315  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  50.15 
 
 		 369 aa  315  8e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  49.51 
 
 		 355 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  49.51 
 
 		 355 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  51.21 
 
 		 331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  45.32 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  49.06 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  44.35 
 
 		 353 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  49.52 
 
 		 337 aa  306  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  45.16 
 
 		 352 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  47.01 
 
 		 333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  44.88 
 
 		 351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  50.49 
 
 		 339 aa  302  7.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  46.85 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  48.3 
 
 		 357 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  47.8 
 
 		 356 aa  298  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  57.43 
 
 		 256 aa  298  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  44.28 
 
 		 352 aa  298  9e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  52.33 
 
 		 281 aa  292  7e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  43.2 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  54.01 
 
 		 242 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  40.22 
 
 		 344 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  53.85 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  51.49 
 
 		 141 aa  149  6e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  53.17 
 
 		 336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  51.26 
 
 		 144 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  50.39 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  55.08 
 
 		 127 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  47.66 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  53.85 
 
 		 126 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  45.16 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  45.16 
 
 		 210 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  42.74 
 
 		 197 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  40.91 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  40.91 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  45.8 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  47.54 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  47.54 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  42.86 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  48.03 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  42.64 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  41.46 
 
 		 330 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  45.69 
 
 		 154 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  42.75 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  41.27 
 
 		 192 aa  102  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  37.5 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  42.61 
 
 		 135 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  62.03 
 
 		 108 aa  99.8  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  54.84 
 
 		 164 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  45 
 
 		 121 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  36.8 
 
 		 198 aa  89.7  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  47.73 
 
 		 90 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  50.72 
 
 		 81 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  45.21 
 
 		 105 aa  68.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  38.2 
 
 		 117 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  43.24 
 
 		 81 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  44.64 
 
 		 55 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0821  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 120 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1452  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 120 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  38.6 
 
 		 88 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.454055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>