96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2544 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  259  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  80.83 
 
 
126 aa  201  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  72.88 
 
 
337 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  67.5 
 
 
281 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  63.87 
 
 
335 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  55.08 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  51.72 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  55.93 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  55 
 
 
334 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  54.31 
 
 
328 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  55.65 
 
 
369 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  49.14 
 
 
341 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  48.28 
 
 
354 aa  124  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  55.08 
 
 
339 aa  122  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  47.9 
 
 
344 aa  121  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  49.14 
 
 
341 aa  121  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  55.96 
 
 
344 aa  120  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  51.28 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  48.72 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  50.85 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  50 
 
 
342 aa  116  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  51.28 
 
 
336 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  48.67 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  47.06 
 
 
333 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  54.13 
 
 
324 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  54.13 
 
 
324 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  46.15 
 
 
340 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  50.43 
 
 
319 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  47.54 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  47.83 
 
 
291 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  54.55 
 
 
340 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  45.3 
 
 
352 aa  109  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  41.88 
 
 
345 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  46.61 
 
 
343 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  49.17 
 
 
338 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  45.61 
 
 
366 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  45.22 
 
 
330 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  44.44 
 
 
331 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  47.01 
 
 
358 aa  107  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  46.15 
 
 
359 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  43.44 
 
 
121 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  44.83 
 
 
356 aa  103  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  44.35 
 
 
210 aa  103  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  42.5 
 
 
192 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  47.83 
 
 
330 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  42.11 
 
 
336 aa  100  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  43.59 
 
 
335 aa  100  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  41.67 
 
 
334 aa  99  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  38.79 
 
 
345 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  38.79 
 
 
345 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  41.53 
 
 
365 aa  97.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  44.83 
 
 
242 aa  96.3  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  42.86 
 
 
337 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  44.74 
 
 
198 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  39.66 
 
 
334 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  42.34 
 
 
332 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  43.1 
 
 
342 aa  95.9  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  40.5 
 
 
342 aa  94.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  37.07 
 
 
344 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  42.24 
 
 
352 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  45.13 
 
 
329 aa  94.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  43.36 
 
 
328 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  41.8 
 
 
343 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  43.36 
 
 
326 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  40.91 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  36.21 
 
 
256 aa  91.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  42.98 
 
 
333 aa  89.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  36.67 
 
 
336 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  41.38 
 
 
333 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  51.09 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  38.74 
 
 
352 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  39.13 
 
 
334 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  34.45 
 
 
327 aa  85.1  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  39.45 
 
 
355 aa  85.5  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  39.45 
 
 
355 aa  85.5  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  40.37 
 
 
356 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  35.34 
 
 
353 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  38.39 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  36.7 
 
 
352 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  35.34 
 
 
353 aa  81.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  34.51 
 
 
357 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  56.52 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  37.61 
 
 
351 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  34.78 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  38.68 
 
 
344 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  34.78 
 
 
361 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  40.54 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  39.44 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  48.21 
 
 
55 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  41.1 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  44 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.454055 
 
 
-
 
NC_002950  PG0821  putative lipoprotein  29.63 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1452  putative lipoprotein  29.63 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  47.73 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  41.51 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>