22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1212 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  694    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  60.98 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  33.56 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  48.48 
 
 		 186 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  47.73 
 
 		 184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  48.62 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  42.67 
 
 		 185 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  29.68 
 
 		 412 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  45.61 
 
 		 194 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  41.84 
 
 		 176 aa  96.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  40.29 
 
 		 205 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  47.12 
 
 		 153 aa  92.4  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  44.74 
 
 		 196 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  36.94 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  33.77 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  37.96 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  34.15 
 
 		 170 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  46.77 
 
 		 68 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  33.33 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  43.75 
 
 		 124 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  32.23 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4388  hypothetical protein  28.04 
 
 		 198 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.716093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>