50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1121 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  849    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  48.4 
 
 		 293 aa  265  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  39.23 
 
 		 205 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  50.38 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  51.75 
 
 		 362 aa  136  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0074  DNA-damage-inducible protein D  47.79 
 
 		 123 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.155764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0060  DNA-damage-inducible protein D  56.48 
 
 		 274 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  47.3 
 
 		 186 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0943  DNA-damage-inducible protein D  53.04 
 
 		 281 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  43.83 
 
 		 184 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  46.9 
 
 		 194 aa  126  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  40.62 
 
 		 185 aa  126  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  41.45 
 
 		 176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3980  DNA-damage-inducible protein D  47.22 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0985266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4147  DNA-damage-inducible protein D  47.22 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920819  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03502  DNA-damage-inducible protein  47.22 
 
 		 278 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5016  DNA-damage-inducible protein D  47.22 
 
 		 274 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.760617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4096  DNA-damage-inducible protein D  47.22 
 
 		 274 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0066  DNA-damage-inducible protein D  47.22 
 
 		 274 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219012  hitchhiker  0.000013205 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03454  hypothetical protein  47.22 
 
 		 274 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  42.57 
 
 		 155 aa  113  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0133  DNA-damage-inducible protein D  46.96 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4089  DNA-damage-inducible protein D  47.79 
 
 		 285 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  29.68 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  46.21 
 
 		 196 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  26.57 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  41.79 
 
 		 153 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1711  DNA-damage-inducible protein D  44.35 
 
 		 284 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2468  DNA-damage-inducible protein D  40.87 
 
 		 284 aa  97.4  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1524  DNA-damage-inducible protein D  43.27 
 
 		 287 aa  96.7  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  37.7 
 
 		 185 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0196  DNA-damage-inducible protein D  36.43 
 
 		 288 aa  94.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0916  DNA-damage-inducible protein D  40.87 
 
 		 241 aa  93.2  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4242  DNA-damage-inducible protein D  40.74 
 
 		 289 aa  90.5  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0033  DNA-damage-inducible protein D  42.72 
 
 		 295 aa  90.1  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1522  hypothetical protein  44.33 
 
 		 187 aa  89.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0766  DNA-damage-inducible protein  42.16 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0312128  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1220  hypothetical protein  52.7 
 
 		 132 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0959  DNA-damage-inducible protein D  40.66 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  33.61 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  27.94 
 
 		 170 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  43.66 
 
 		 109 aa  68.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1486  DNA-damage-inducible protein  36.36 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  36.04 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  39.74 
 
 		 124 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  53.57 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0161  hypothetical protein  36.07 
 
 		 92 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2920  hypothetical protein  28.97 
 
 		 208 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3407  hypothetical protein  24.84 
 
 		 248 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4169  hypothetical protein  42.31 
 
 		 67 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>