24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0596 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  48.4 
 
 
412 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  38.93 
 
 
291 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  33.56 
 
 
339 aa  154  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  32.81 
 
 
358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  42.69 
 
 
205 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  42.29 
 
 
184 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  42.21 
 
 
194 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  41.51 
 
 
186 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  39.87 
 
 
176 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  41.56 
 
 
196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  38.16 
 
 
185 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  43.09 
 
 
185 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  44.25 
 
 
170 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  40.98 
 
 
254 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  35.54 
 
 
264 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  34.78 
 
 
155 aa  90.5  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  36.84 
 
 
153 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1220  hypothetical protein  67.92 
 
 
132 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  54.84 
 
 
109 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  46.38 
 
 
68 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  30.43 
 
 
124 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2920  hypothetical protein  29.09 
 
 
208 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3407  hypothetical protein  27.43 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520237  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>