22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1167 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  728    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  60.98 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  32.81 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  49.21 
 
 		 176 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  43.17 
 
 		 205 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  26.57 
 
 		 412 aa  105  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  42.75 
 
 		 186 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  42.03 
 
 		 184 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  44.26 
 
 		 194 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  42.06 
 
 		 185 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  46.79 
 
 		 153 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  34.97 
 
 		 185 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  49.45 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  26.98 
 
 		 264 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  36.21 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  49.23 
 
 		 68 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  27.67 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  38.03 
 
 		 109 aa  57.4  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  43.4 
 
 		 124 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1220  hypothetical protein  45.83 
 
 		 132 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>