196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2527 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2527  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
232 aa  461  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.513759  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.95 
 
 
139 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  34.69 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  35.05 
 
 
182 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  35.48 
 
 
139 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  31.63 
 
 
181 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  32.63 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  37.62 
 
 
106 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.33 
 
 
435 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 
179 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
139 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  31.96 
 
 
181 aa  55.1  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  38.46 
 
 
525 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.77 
 
 
175 aa  55.1  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  43.33 
 
 
516 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  32.26 
 
 
139 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.92 
 
 
525 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  33.6 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 
504 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0423  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.25 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  35.21 
 
 
181 aa  52.4  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 
159 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.67 
 
 
133 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00196635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1970  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.41 
 
 
109 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
521 aa  52.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0192  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.67 
 
 
193 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014793  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
146 aa  52  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.89 
 
 
159 aa  51.6  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
482 aa  52  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.04 
 
 
105 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  30.3 
 
 
182 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
524 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5928  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.84 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
499 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 
508 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
159 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.4 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
149 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2712  Rieske (2Fe-2S) region  38.46 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  32.35 
 
 
508 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
513 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1447  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.95 
 
 
170 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
592 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.29 
 
 
171 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 
512 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  32.35 
 
 
508 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1432  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.4 
 
 
170 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.4 
 
 
170 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.4 
 
 
170 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000922342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.05 
 
 
185 aa  48.9  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 
506 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1649  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.4 
 
 
170 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.670626  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1329  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.47 
 
 
118 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316396  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
508 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2851  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.1 
 
 
167 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.61 
 
 
639 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  30.88 
 
 
508 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.88 
 
 
508 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  30.88 
 
 
508 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  30.88 
 
 
508 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  33.33 
 
 
110 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  39.13 
 
 
504 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  39.19 
 
 
131 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.88 
 
 
508 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  32.67 
 
 
125 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  37.5 
 
 
63 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.88 
 
 
508 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.88 
 
 
508 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 
385 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
513 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 
520 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  35.62 
 
 
160 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  40.82 
 
 
510 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2703  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  36.05 
 
 
146 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  47.62 
 
 
648 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1751  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.03 
 
 
155 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.37 
 
 
381 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.96 
 
 
130 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
642 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 
507 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0244  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.73 
 
 
116 aa  47  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.250681 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.67 
 
 
469 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0997  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.19 
 
 
109 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.035917  hitchhiker  0.00920354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
526 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
130 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  44.26 
 
 
315 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.84 
 
 
479 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  30.88 
 
 
521 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2679  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.93 
 
 
437 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3259  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.11 
 
 
269 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 
138 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
513 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46657  predicted protein  41.67 
 
 
217 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  35.71 
 
 
178 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3337  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.11 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.61 
 
 
166 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
531 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 
508 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1246  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.19 
 
 
170 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
585 aa  45.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>