More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1939 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1939  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2227  nucleoside diphosphate kinase  98.6 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3466  nucleoside diphosphate kinase  53.79 
 
 		 135 aa  149  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  53.73 
 
 		 136 aa  147  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  50.75 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0387  nucleoside diphosphate kinase  51.11 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3489  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  48.89 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  52.24 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  50.76 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  51.88 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  50.76 
 
 		 141 aa  143  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2228  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0390683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  52.99 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  50.75 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  47.41 
 
 		 138 aa  140  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3868  nucleoside diphosphate kinase  47.76 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211598  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  48.51 
 
 		 136 aa  140  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  50.76 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  48.85 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  50.75 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3557  nucleoside diphosphate kinase  51.52 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  45.8 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  51.52 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  52.27 
 
 		 138 aa  137  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3625  nucleoside diphosphate kinase  51.52 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  53.08 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  46.56 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  46.56 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  42.75 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 133 aa  136  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  47.89 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  47.89 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  45.77 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  50.37 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  50.75 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  48.87 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  44.36 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  45.04 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2633  nucleoside diphosphate kinase  51.49 
 
 		 136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  51.52 
 
 		 136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  46.56 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  42.14 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2872  nucleoside-diphosphate kinase  49.25 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  47.69 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0684  Nucleoside-diphosphate kinase  48.85 
 
 		 135 aa  133  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33705  normal  0.254357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  46.62 
 
 		 139 aa  133  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  49.3 
 
 		 141 aa  133  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0907  nucleoside-diphosphate kinase  47.52 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  45.59 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  49.25 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  47.55 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  46.48 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  47.76 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  49.25 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  49.63 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  43.51 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  44 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  49.25 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42104  nucleoside diphosphate kinase 2  42.86 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  47.69 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  48.59 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  42.75 
 
 		 150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  41.22 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  47.79 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  48.46 
 
 		 139 aa  130  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  47.79 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  47.79 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  45.77 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  47.79 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  47.79 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  40.46 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  47.79 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  48.53 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  47.79 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  47.33 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  44.85 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  45.52 
 
 		 135 aa  130  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  47.01 
 
 		 141 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  46.85 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  42.31 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  45.8 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  45.8 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  47.89 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0102  nucleoside diphosphate kinase  44.27 
 
 		 131 aa  130  9e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.874846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  44.27 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  40.14 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  42.75 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  48.53 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  44.85 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  46.43 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  46.62 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  45.07 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>