More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0127 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  66.44 
 
 		 149 aa  228  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  67.11 
 
 		 149 aa  225  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  67.79 
 
 		 150 aa  224  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  64.43 
 
 		 149 aa  217  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  63.95 
 
 		 149 aa  217  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  66.22 
 
 		 166 aa  216  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  62.84 
 
 		 149 aa  215  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  66.22 
 
 		 148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  66.22 
 
 		 148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  66.22 
 
 		 148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  66.22 
 
 		 148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  66.22 
 
 		 148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  66.22 
 
 		 148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  64.86 
 
 		 148 aa  214  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  65.54 
 
 		 148 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  65.54 
 
 		 148 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  65.54 
 
 		 148 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  61.74 
 
 		 151 aa  208  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  60.4 
 
 		 149 aa  207  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  62.25 
 
 		 155 aa  206  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  59.73 
 
 		 149 aa  202  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  59.73 
 
 		 149 aa  202  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  59.06 
 
 		 149 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  57.72 
 
 		 149 aa  201  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  59.06 
 
 		 149 aa  200  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  57.72 
 
 		 149 aa  200  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  70.07 
 
 		 138 aa  199  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 		 160 aa  198  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 		 143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  68.61 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  58.39 
 
 		 151 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  60.14 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  56.38 
 
 		 149 aa  194  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  57.05 
 
 		 149 aa  193  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  56.38 
 
 		 149 aa  193  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  59.73 
 
 		 149 aa  193  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  58.67 
 
 		 159 aa  192  9e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  55.03 
 
 		 149 aa  192  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  58.11 
 
 		 151 aa  190  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  54.05 
 
 		 152 aa  189  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67856  nucleoside diphosphate kinase  55.41 
 
 		 152 aa  189  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194795  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  56.76 
 
 		 153 aa  188  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  58.74 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  55.7 
 
 		 151 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  55.03 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  56.08 
 
 		 150 aa  187  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2814  nucleoside diphosphate kinase  62.25 
 
 		 151 aa  186  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  56.08 
 
 		 151 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  54.05 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  55.03 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  56.08 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  54.79 
 
 		 152 aa  183  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  56.38 
 
 		 152 aa  183  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1604  nucleoside diphosphate kinase  55.7 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00471  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.602397  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25127  nucleoside diphosphate kinase 3  54.05 
 
 		 217 aa  177  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439497  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  52 
 
 		 154 aa  177  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  52 
 
 		 154 aa  176  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00531  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 152 aa  175  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00491  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 152 aa  175  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0047  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  52.35 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  52.74 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0718  nucleoside diphosphate kinase  55.03 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0214366  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  57.04 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02610  nucleoside-diphosphate kinase, putative  52.03 
 
 		 152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42104  nucleoside diphosphate kinase 2  53.69 
 
 		 148 aa  170  6.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  58.46 
 
 		 137 aa  170  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 139 aa  169  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26635  predicted protein  54.86 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  57.69 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  58.46 
 
 		 136 aa  167  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0687  nucleoside diphosphate kinase  53.02 
 
 		 150 aa  166  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.36763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  55.64 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  50.35 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  53.44 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  50.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0381  nucleoside-diphosphate kinase  52.52 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 135 aa  160  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  55.81 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  47.95 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  55.38 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  54.14 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  52.67 
 
 		 136 aa  155  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  52.67 
 
 		 134 aa  156  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  51.77 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  51.06 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  54.96 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  48.94 
 
 		 164 aa  154  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0102  nucleoside diphosphate kinase  52.67 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.874846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  51.06 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  51.06 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>