More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2031 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 154 aa  313  5e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  55.48 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  49.32 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  48.63 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  48.63 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  47.95 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  52 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  47.95 
 
 		 148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  47.95 
 
 		 148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  47.26 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  47.26 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  47.26 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  47.26 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  47.26 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  47.26 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  46.58 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 		 149 aa  159  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  50.68 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  47.95 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  49.32 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  51.37 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3489  nucleoside diphosphate kinase  56.82 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  50.68 
 
 		 149 aa  156  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3868  nucleoside diphosphate kinase  57.58 
 
 		 141 aa  156  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211598  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  48.67 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  49.32 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  48.32 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3466  nucleoside diphosphate kinase  58.91 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  47.95 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  52.59 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  46.94 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  50.35 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  58.33 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  47.26 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  47.26 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  47.26 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  52.52 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0684  Nucleoside-diphosphate kinase  54.2 
 
 		 135 aa  150  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33705  normal  0.254357 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  56.82 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  49.29 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  51.43 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  45 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  58.33 
 
 		 136 aa  148  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2814  nucleoside diphosphate kinase  51.35 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1604  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  44.22 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  47.97 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  47.26 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  45.21 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  54.96 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  46.58 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  44.9 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2633  nucleoside diphosphate kinase  57.58 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  56.82 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  43.15 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  55.38 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 139 aa  144  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  53.08 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  57.58 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3557  nucleoside diphosphate kinase  57.58 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3625  nucleoside diphosphate kinase  57.58 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  47.18 
 
 		 143 aa  143  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  48.53 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  44.59 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  54.26 
 
 		 135 aa  141  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  54.2 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2667  nucleoside-diphosphate kinase  44.44 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  49.64 
 
 		 143 aa  141  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  45.39 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  51.88 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  53.49 
 
 		 140 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  49.3 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  44.68 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  47.37 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2149  Nucleoside-diphosphate kinase  52.55 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0687  nucleoside diphosphate kinase  47.14 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.36763 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1505  nucleoside diphosphate kinase  47.86 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  47.86 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  48.92 
 
 		 164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  47.86 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  51.52 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3326  nucleoside-diphosphate kinase  48.92 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  41.3 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  54.55 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>