More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0047 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0047  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 
152 aa  311  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00471  nucleoside diphosphate kinase  97.37 
 
 
152 aa  304  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.602397  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00491  nucleoside diphosphate kinase  97.37 
 
 
152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00531  nucleoside diphosphate kinase  86.18 
 
 
152 aa  277  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  78.81 
 
 
151 aa  253  9e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  78.15 
 
 
151 aa  252  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  78.29 
 
 
152 aa  250  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  76.51 
 
 
151 aa  241  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  74.83 
 
 
151 aa  240  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  74.5 
 
 
151 aa  236  8e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  68.87 
 
 
151 aa  218  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  69.59 
 
 
149 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  66.89 
 
 
149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  66.22 
 
 
149 aa  208  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  66.89 
 
 
149 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  65.54 
 
 
149 aa  204  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  65.49 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  59.31 
 
 
149 aa  191  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  58.62 
 
 
149 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  62.68 
 
 
143 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  55.86 
 
 
166 aa  185  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 
148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 
148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 
148 aa  179  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 
148 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 
148 aa  179  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 
148 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 
148 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 
148 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 
148 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  53.79 
 
 
148 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  56.85 
 
 
152 aa  177  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  54.97 
 
 
153 aa  176  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67856  nucleoside diphosphate kinase  54.67 
 
 
152 aa  175  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194795  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 
149 aa  174  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  56.08 
 
 
150 aa  174  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  54.73 
 
 
149 aa  174  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  55.86 
 
 
149 aa  173  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26635  predicted protein  58.04 
 
 
144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  52.98 
 
 
160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  61.07 
 
 
139 aa  170  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  53.33 
 
 
155 aa  170  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25127  nucleoside diphosphate kinase 3  54.48 
 
 
217 aa  169  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439497  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  52 
 
 
154 aa  169  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 
149 aa  168  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  52.03 
 
 
149 aa  167  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  52.03 
 
 
149 aa  167  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  52.7 
 
 
149 aa  167  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  52.32 
 
 
159 aa  166  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  51.03 
 
 
152 aa  165  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  53.02 
 
 
150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  55.15 
 
 
138 aa  163  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42104  nucleoside diphosphate kinase 2  52.03 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  49.33 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 
142 aa  161  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02610  nucleoside-diphosphate kinase, putative  52 
 
 
152 aa  161  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 
142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 
149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 
137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  51.03 
 
 
150 aa  160  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 
142 aa  159  9e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 
137 aa  159  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  50.68 
 
 
149 aa  159  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  54.23 
 
 
143 aa  158  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  52.9 
 
 
139 aa  158  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  55.3 
 
 
136 aa  157  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  52.94 
 
 
138 aa  155  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  45.52 
 
 
149 aa  153  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  46.21 
 
 
149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  46.9 
 
 
151 aa  150  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  50.74 
 
 
137 aa  149  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 
143 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  47.89 
 
 
149 aa  148  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  48.84 
 
 
135 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 
137 aa  148  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  51.47 
 
 
139 aa  147  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  45.95 
 
 
149 aa  147  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1604  nucleoside diphosphate kinase  47.65 
 
 
149 aa  147  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 
142 aa  147  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  49.28 
 
 
138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0718  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0214366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  53.08 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  51.54 
 
 
136 aa  144  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  48.2 
 
 
143 aa  144  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 
147 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  49.63 
 
 
137 aa  144  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 
141 aa  144  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 
140 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  46.81 
 
 
146 aa  143  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  47.89 
 
 
149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  47.48 
 
 
143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  48.92 
 
 
143 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 
147 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 
137 aa  143  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  50.36 
 
 
143 aa  143  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  50.76 
 
 
136 aa  143  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  50.74 
 
 
137 aa  143  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  48.09 
 
 
136 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.26878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>