More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0394 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  99.3 
 
 		 142 aa  289  8e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  97.18 
 
 		 142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  60.28 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  55 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  52.48 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  51.77 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  53.9 
 
 		 151 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 151 aa  167  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  53.19 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  54.61 
 
 		 146 aa  166  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  52.14 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  52.86 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00531  nucleoside diphosphate kinase  53.24 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  52.14 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  53.52 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  54.29 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  52.86 
 
 		 149 aa  165  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  52.82 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  53.62 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  52.82 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 166 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  49.29 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 148 aa  163  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 148 aa  163  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00471  nucleoside diphosphate kinase  53.96 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.602397  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  53.24 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  50.35 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  50.35 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0047  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  50.35 
 
 		 155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00491  nucleoside diphosphate kinase  52.52 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  52.52 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  54.55 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  49.3 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  54.62 
 
 		 139 aa  156  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  52.24 
 
 		 143 aa  156  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  51.06 
 
 		 143 aa  156  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  55.38 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  51.09 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  48.57 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  46.76 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  46.76 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  48.23 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  48.51 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  52.63 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  52.48 
 
 		 149 aa  153  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  48.53 
 
 		 139 aa  153  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  45.39 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  54.55 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  53.79 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  51.77 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  47.1 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  48.53 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  50.35 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  47.45 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  52.94 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  47.45 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  46.72 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  47.45 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  50.37 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  47.45 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  45.59 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  51.15 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  147  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  47.52 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  49.26 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  50.36 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  48.18 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>