More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1210 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 137 aa  268  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  94.16 
 
 		 137 aa  256  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  73.88 
 
 		 136 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  72.52 
 
 		 136 aa  205  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  72.52 
 
 		 136 aa  203  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  75 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  69.4 
 
 		 134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  70.15 
 
 		 136 aa  193  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  66.42 
 
 		 135 aa  190  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  67.41 
 
 		 136 aa  187  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  64.44 
 
 		 135 aa  186  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  65.93 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3557  nucleoside diphosphate kinase  65.67 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  65.67 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  69.4 
 
 		 136 aa  181  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3625  nucleoside diphosphate kinase  65.67 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  62.69 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  63.97 
 
 		 141 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  67.16 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  58.78 
 
 		 149 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  59.7 
 
 		 152 aa  176  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  58.46 
 
 		 149 aa  176  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  61.07 
 
 		 151 aa  174  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  58.02 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  61.19 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  60.31 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2633  nucleoside diphosphate kinase  62.69 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  58.46 
 
 		 139 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  58.78 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2558  Nucleoside-diphosphate kinase  57.86 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.927598  normal  0.152137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  57.25 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3490  Nucleoside-diphosphate kinase  58.99 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3466  nucleoside diphosphate kinase  60.61 
 
 		 135 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  52.24 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  54.62 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0976  Nucleoside-diphosphate kinase  56.12 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  58.46 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  58.02 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  53.44 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  52.67 
 
 		 166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0047  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  58.65 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  53.44 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  54.2 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  54.2 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  54.2 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00491  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0684  Nucleoside-diphosphate kinase  58.02 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33705  normal  0.254357 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26635  predicted protein  55.2 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  56.92 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02610  nucleoside-diphosphate kinase, putative  51.13 
 
 		 152 aa  157  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00471  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.602397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  52.67 
 
 		 148 aa  157  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  56 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  51.91 
 
 		 149 aa  157  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  53.79 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  52.99 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 148 aa  157  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 148 aa  156  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 148 aa  156  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 148 aa  156  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 148 aa  156  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 148 aa  156  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 139 aa  157  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1461  Nucleoside-diphosphate kinase  59.12 
 
 		 144 aa  156  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0805889  normal  0.284135 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 148 aa  156  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3868  nucleoside diphosphate kinase  57.89 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211598  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3489  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.985666 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  50.38 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  51.15 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  53.79 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23840  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.882593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  52.27 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  52.24 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  52.24 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1604  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  56 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1158  Nucleoside-diphosphate kinase  57.55 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00531  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  53.6 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  51.49 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  50.38 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>