More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0127 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 
138 aa  280  7.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  90.58 
 
 
138 aa  257  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  68.61 
 
 
149 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 
149 aa  188  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  64.71 
 
 
149 aa  184  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  63.5 
 
 
151 aa  184  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 
149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  66.15 
 
 
136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  65.38 
 
 
136 aa  181  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  58.39 
 
 
149 aa  180  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  61.76 
 
 
149 aa  179  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  60.58 
 
 
150 aa  178  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 
139 aa  177  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  61.03 
 
 
149 aa  177  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  63.08 
 
 
137 aa  175  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 
149 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 
166 aa  174  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  57.97 
 
 
150 aa  174  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  61.54 
 
 
134 aa  174  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 
148 aa  173  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  60.31 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 
152 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 
149 aa  169  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  56.3 
 
 
151 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 
151 aa  169  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 
149 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  57.78 
 
 
138 aa  168  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 
148 aa  168  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 
155 aa  169  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  61.07 
 
 
136 aa  167  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 
160 aa  167  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06060  nucleoside diphosphate kinase  58.78 
 
 
134 aa  167  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.678172  hitchhiker  0.00000000266353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  59.23 
 
 
136 aa  167  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 
140 aa  167  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  61.07 
 
 
135 aa  166  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  59.23 
 
 
152 aa  166  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  56.62 
 
 
148 aa  166  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
149 aa  166  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 
151 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  61.83 
 
 
143 aa  165  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  60.31 
 
 
134 aa  165  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 
151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 
149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  58.91 
 
 
140 aa  164  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  59.54 
 
 
135 aa  164  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  58.78 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  58.02 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 
151 aa  161  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 
141 aa  161  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 
149 aa  161  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  52.17 
 
 
149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  56.49 
 
 
138 aa  160  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  52.9 
 
 
149 aa  159  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  53.79 
 
 
139 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  58.78 
 
 
136 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 
137 aa  158  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 
149 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  58.78 
 
 
133 aa  158  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3557  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 
149 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252245  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3625  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 
149 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  57.69 
 
 
143 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 
143 aa  157  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  54.35 
 
 
139 aa  157  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  57.04 
 
 
153 aa  157  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  52.9 
 
 
143 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1604  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 
149 aa  157  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 
143 aa  157  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2633  nucleoside diphosphate kinase  58.02 
 
 
136 aa  156  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0272409  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 
149 aa  156  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 
149 aa  155  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00531  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 
152 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  52.21 
 
 
152 aa  155  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 
137 aa  155  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 
136 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0047  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 
152 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 
141 aa  155  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00471  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 
152 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.602397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  51.45 
 
 
140 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 
137 aa  154  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00491  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 
152 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09200  nucleoside diphosphate kinase  58.78 
 
 
135 aa  154  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.397832  normal  0.262765 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 
137 aa  154  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 
137 aa  154  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 
142 aa  154  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 
143 aa  154  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 
141 aa  154  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  51.82 
 
 
164 aa  153  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>