More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09200 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09200  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.397832  normal  0.262765 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06060  nucleoside diphosphate kinase  82.71 
 
 		 134 aa  223  8e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.678172  hitchhiker  0.00000000266353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  81.95 
 
 		 134 aa  221  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  58.65 
 
 		 139 aa  160  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  58.65 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  59.54 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  58.78 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  54.2 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  53.44 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  54.55 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  53.38 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  51.49 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0765  Nucleoside-diphosphate kinase  53.79 
 
 		 136 aa  147  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0463345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  52.99 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  54.81 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  53.33 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  54.07 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  54.07 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2802  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 143 aa  146  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  54.07 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  55.38 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  52.24 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1286  nucleoside diphosphate kinase  53.79 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2721  nucleoside diphosphate kinase  52.59 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  53.44 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2765  nucleoside diphosphate kinase  52.59 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2896  nucleoside diphosphate kinase  52.59 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2678  nucleoside diphosphate kinase  52.59 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2784  nucleoside diphosphate kinase  52.59 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  50.75 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  52.24 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  51.11 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  53.44 
 
 		 136 aa  143  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  49.63 
 
 		 141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 143 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 143 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  51.15 
 
 		 134 aa  143  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1390  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  51.15 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  52.59 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  50.75 
 
 		 143 aa  141  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  53.03 
 
 		 133 aa  140  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  50.37 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0670  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  54.2 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 143 aa  140  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  49.25 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  50.76 
 
 		 148 aa  140  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3018  nucleoside diphosphate kinase  48.15 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 141 aa  140  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  49.25 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  49.23 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  52.24 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  49.63 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  52.67 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  47.37 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1254  nucleoside diphosphate kinase  48.15 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  55.12 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>