More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0765 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0765  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 136 aa  268  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0463345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  61.65 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  57.89 
 
 		 136 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  56.3 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  55.73 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  57.58 
 
 		 149 aa  157  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06060  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 134 aa  156  7e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.678172  hitchhiker  0.00000000266353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  57.89 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3557  nucleoside diphosphate kinase  58.65 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  58.65 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3625  nucleoside diphosphate kinase  58.65 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  56.06 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2633  nucleoside diphosphate kinase  58.65 
 
 		 136 aa  153  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  54.55 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  54.48 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2814  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  55.64 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  56.72 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  52.99 
 
 		 135 aa  150  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  56.06 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  58.02 
 
 		 140 aa  150  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  53.03 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2558  Nucleoside-diphosphate kinase  57.35 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.927598  normal  0.152137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0976  Nucleoside-diphosphate kinase  52.86 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  54.89 
 
 		 136 aa  147  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  50.74 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0684  Nucleoside-diphosphate kinase  56.72 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33705  normal  0.254357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  55.64 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09200  nucleoside diphosphate kinase  53.79 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.397832  normal  0.262765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  57.58 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 136 aa  147  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3490  Nucleoside-diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  58.65 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  54.14 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  52.27 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  51.88 
 
 		 152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09190  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.513672 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  53.79 
 
 		 149 aa  141  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  53.08 
 
 		 143 aa  141  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 139 aa  140  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  46.32 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  48.55 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  52.27 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  52.24 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  48.85 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  45.93 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  48.89 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  47.41 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  45.59 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  45.59 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  53.03 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  53.03 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  49.24 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1461  Nucleoside-diphosphate kinase  55.15 
 
 		 144 aa  137  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0805889  normal  0.284135 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  47.73 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  52.27 
 
 		 143 aa  136  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  48.53 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23840  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.882593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3466  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09920  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  48.89 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0905  nucleoside diphosphate kinase  43.07 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.244999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  43.38 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 143 aa  133  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  51.52 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  51.85 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3868  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211598  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10080  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  47.01 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  47.73 
 
 		 141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3489  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  44.85 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  45.59 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  44.85 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  48.53 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  47.73 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  48.48 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0929  nucleoside diphosphate kinase  45.59 
 
 		 142 aa  130  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.108776  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  44.36 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  44.85 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  49.24 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  46.32 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  45.59 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  45.59 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  49.24 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  49.24 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>