More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0029 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  70.29 
 
 		 138 aa  211  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  57.04 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  59.54 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  60 
 
 		 138 aa  167  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  60 
 
 		 138 aa  166  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  54.74 
 
 		 148 aa  163  5.9999999999999996e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  53.24 
 
 		 152 aa  163  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  54.89 
 
 		 137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  52.17 
 
 		 139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  56.15 
 
 		 135 aa  160  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  54.81 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  58.96 
 
 		 134 aa  159  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  55.38 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  52.21 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  53.24 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  54.07 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  52.59 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  50.74 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  52.55 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  55.73 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0684  Nucleoside-diphosphate kinase  53.73 
 
 		 135 aa  156  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33705  normal  0.254357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 149 aa  156  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  53.96 
 
 		 152 aa  156  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0381  nucleoside-diphosphate kinase  50.36 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  54.55 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3625  nucleoside diphosphate kinase  54.55 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3557  nucleoside diphosphate kinase  54.55 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  53.79 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  49.29 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  53.85 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  51.45 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  52.17 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0526  nucleoside diphosphate kinase  56.59 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  54.55 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09200  nucleoside diphosphate kinase  55.64 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.397832  normal  0.262765 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  52.59 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06060  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.678172  hitchhiker  0.00000000266353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  52.27 
 
 		 136 aa  149  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  51.45 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  51.15 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  45 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0976  Nucleoside-diphosphate kinase  51.11 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  51.94 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0038  nucleoside-diphosphate kinase  46.72 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  48.18 
 
 		 166 aa  147  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  49.29 
 
 		 159 aa  147  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  47.45 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  47.45 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  48.92 
 
 		 154 aa  146  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  50 
 
 		 150 aa  146  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0907  nucleoside-diphosphate kinase  47.1 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  52.27 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  50.37 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  47.1 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  48.15 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3489  nucleoside diphosphate kinase  49.23 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  50.71 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3868  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211598  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  49.28 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  48.15 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  47.41 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  48.2 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2633  nucleoside diphosphate kinase  53.03 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  49.24 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  51.52 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  51.52 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0102  nucleoside diphosphate kinase  48.46 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.874846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  47.48 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  48.15 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>