More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06060 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06060  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 134 aa  274  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.678172  hitchhiker  0.00000000266353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  90.23 
 
 		 134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09200  nucleoside diphosphate kinase  82.71 
 
 		 135 aa  223  8e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.397832  normal  0.262765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  60.31 
 
 		 138 aa  170  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  58.78 
 
 		 138 aa  167  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  57.46 
 
 		 139 aa  159  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  55.64 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0765  Nucleoside-diphosphate kinase  57.25 
 
 		 136 aa  156  7e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0463345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  54.96 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  54.2 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  56.39 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  54.2 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  53.08 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  52.67 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  55.38 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  57.14 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  53.49 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  52.9 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 140 aa  150  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  52.24 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  51.91 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  53.44 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  52.59 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  54.62 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  50.77 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  51.15 
 
 		 151 aa  146  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 137 aa  146  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  51.49 
 
 		 143 aa  146  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  48.51 
 
 		 138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  52.24 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  53.85 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  53.08 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  53.85 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  49.23 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  50.75 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  52.31 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  50.75 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  52.67 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 143 aa  143  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  50.75 
 
 		 160 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  50.75 
 
 		 143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  49.24 
 
 		 148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  52.67 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  53.73 
 
 		 136 aa  143  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  53.44 
 
 		 136 aa  143  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  52.99 
 
 		 136 aa  143  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  51.15 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 143 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 143 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  51.15 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  48.51 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  50.37 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  51.88 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  50.75 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  50.75 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  48.87 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0905  nucleoside diphosphate kinase  48.53 
 
 		 138 aa  140  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.244999  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  51.49 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0718  nucleoside diphosphate kinase  54.26 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0214366  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  49.25 
 
 		 143 aa  140  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  47.33 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  55.97 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  52.67 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  49.25 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  48.09 
 
 		 149 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  48.87 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>