More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3385 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  73.15 
 
 		 149 aa  236  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  67.13 
 
 		 143 aa  207  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1604  nucleoside diphosphate kinase  61.07 
 
 		 149 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 149 aa  198  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0718  nucleoside diphosphate kinase  60.4 
 
 		 149 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0214366  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0526  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 149 aa  193  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  59.73 
 
 		 149 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0687  nucleoside diphosphate kinase  57.72 
 
 		 150 aa  191  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.36763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  57.05 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  55.63 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  64.71 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  58.78 
 
 		 151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  65.15 
 
 		 136 aa  181  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  52.7 
 
 		 149 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  56 
 
 		 160 aa  178  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  54.36 
 
 		 149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  56 
 
 		 154 aa  177  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  63.97 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  55.7 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  56 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  55.41 
 
 		 153 aa  176  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  53.69 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  53.02 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  52.38 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  55.48 
 
 		 152 aa  172  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  61.36 
 
 		 136 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02610  nucleoside-diphosphate kinase, putative  54.73 
 
 		 152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  51.68 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  50.68 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  51.68 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  51.01 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  52.03 
 
 		 150 aa  171  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  54 
 
 		 159 aa  170  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  51.01 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  52.7 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  58.65 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  58.46 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  59.09 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  59.4 
 
 		 135 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  51.01 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  54.11 
 
 		 148 aa  167  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  51.68 
 
 		 149 aa  167  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  48.65 
 
 		 148 aa  163  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67856  nucleoside diphosphate kinase  49.32 
 
 		 152 aa  163  9e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194795  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  55.56 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  48.65 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  48.65 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  51.75 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  47.65 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  50 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2814  nucleoside diphosphate kinase  52.98 
 
 		 151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  47.97 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  47.97 
 
 		 152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  47.97 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  47.97 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  47.97 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  47.97 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  59.69 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  47.97 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  48.32 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  47.97 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  54.81 
 
 		 140 aa  160  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  57.25 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  47.65 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  54.96 
 
 		 135 aa  158  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 		 139 aa  157  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  49.66 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 		 136 aa  156  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25127  nucleoside diphosphate kinase 3  47.97 
 
 		 217 aa  156  9e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  55.73 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  57.25 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  56.49 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  53.08 
 
 		 134 aa  154  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2633  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  46.98 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  46.31 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  52.59 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  49.65 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  51.06 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42104  nucleoside diphosphate kinase 2  46.31 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06060  nucleoside diphosphate kinase  52.67 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.678172  hitchhiker  0.00000000266353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 133 aa  151  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00531  nucleoside diphosphate kinase  48.59 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  50.35 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  50.35 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  47.55 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  54.2 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26635  predicted protein  55.12 
 
 		 144 aa  150  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  54.2 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00491  nucleoside diphosphate kinase  47.18 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>