More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1604 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1604  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 
149 aa  309  6.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0687  nucleoside diphosphate kinase  65.77 
 
 
150 aa  222  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.36763 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0718  nucleoside diphosphate kinase  66.44 
 
 
149 aa  221  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0214366  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0526  nucleoside diphosphate kinase  63.76 
 
 
149 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  65.1 
 
 
149 aa  207  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  61.07 
 
 
149 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  59.06 
 
 
149 aa  190  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  56.76 
 
 
149 aa  190  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 
149 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  56.08 
 
 
148 aa  186  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  55.78 
 
 
149 aa  185  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  56.95 
 
 
155 aa  184  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  54.05 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  55.7 
 
 
149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  54.05 
 
 
148 aa  181  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  54.05 
 
 
148 aa  181  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 
148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 
148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 
148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 
148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 
148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 
148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 
166 aa  180  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  53.38 
 
 
153 aa  178  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02610  nucleoside-diphosphate kinase, putative  56.08 
 
 
152 aa  178  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  55.33 
 
 
160 aa  179  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  54.05 
 
 
150 aa  177  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67856  nucleoside diphosphate kinase  55.41 
 
 
152 aa  177  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194795  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  53.69 
 
 
149 aa  176  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  55.7 
 
 
151 aa  175  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  52.35 
 
 
149 aa  175  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  58.74 
 
 
143 aa  174  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  51.68 
 
 
149 aa  173  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  49.32 
 
 
152 aa  172  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  53.69 
 
 
149 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  55.7 
 
 
150 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  53.02 
 
 
149 aa  172  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  53.69 
 
 
149 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  56 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  54.67 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  52.35 
 
 
149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  55.33 
 
 
159 aa  170  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  54.11 
 
 
152 aa  168  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  53.69 
 
 
149 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42104  nucleoside diphosphate kinase 2  53.69 
 
 
148 aa  168  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  51.01 
 
 
149 aa  167  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  52.35 
 
 
151 aa  166  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  51.01 
 
 
149 aa  166  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  51.01 
 
 
149 aa  165  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  50.34 
 
 
149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  52.98 
 
 
152 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  52.03 
 
 
151 aa  163  9e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  51.35 
 
 
151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  50.67 
 
 
151 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  51.05 
 
 
143 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  47.65 
 
 
149 aa  159  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  46.62 
 
 
150 aa  158  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  56.93 
 
 
138 aa  157  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  57.66 
 
 
138 aa  157  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25127  nucleoside diphosphate kinase 3  47.97 
 
 
217 aa  155  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439497  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  50.67 
 
 
151 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  50.67 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  50.35 
 
 
143 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2814  nucleoside diphosphate kinase  51.66 
 
 
151 aa  151  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  54.96 
 
 
137 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  53.33 
 
 
138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  51.52 
 
 
139 aa  150  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 
139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26635  predicted protein  57.6 
 
 
144 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  56.15 
 
 
136 aa  149  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  55.38 
 
 
137 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00531  nucleoside diphosphate kinase  47.65 
 
 
152 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  48.92 
 
 
154 aa  148  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 
135 aa  147  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00471  nucleoside diphosphate kinase  46.98 
 
 
152 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.602397  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0047  nucleoside diphosphate kinase  47.65 
 
 
152 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  53.44 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00491  nucleoside diphosphate kinase  46.98 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  46.58 
 
 
148 aa  144  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  48.23 
 
 
143 aa  144  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  54.62 
 
 
136 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  48.23 
 
 
142 aa  144  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  48.23 
 
 
142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  52.31 
 
 
136 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  50.38 
 
 
134 aa  143  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 
143 aa  141  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  47.52 
 
 
143 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  47.52 
 
 
142 aa  141  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  51.94 
 
 
140 aa  141  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  48.89 
 
 
140 aa  141  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  47.45 
 
 
141 aa  140  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  53.08 
 
 
134 aa  139  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0905  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.244999  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3868  nucleoside diphosphate kinase  48.89 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211598  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  46.81 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>