More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0381 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0381  nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0038  nucleoside-diphosphate kinase  76.87 
 
 		 147 aa  240  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0907  nucleoside-diphosphate kinase  58.22 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  55.56 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  55 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  54.61 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  51.8 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  52.52 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  54.35 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  50.71 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  52.52 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  52.52 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  53.79 
 
 		 136 aa  155  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  52.27 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  52.31 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  51.8 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  50.72 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  53.49 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  54.01 
 
 		 138 aa  150  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  51.09 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  47.48 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 166 aa  147  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  46.53 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  48.92 
 
 		 151 aa  146  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  54.2 
 
 		 136 aa  146  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  51.13 
 
 		 134 aa  146  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 149 aa  146  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  49.29 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  48.09 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  46.72 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  47.22 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  45.32 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  46.81 
 
 		 155 aa  143  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  50.38 
 
 		 135 aa  144  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 136 aa  143  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  46.04 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  48.92 
 
 		 149 aa  141  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1295  nucleoside diphosphate kinase  51.52 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  48.48 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  47.48 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  47.48 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  46.76 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1390  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 139 aa  139  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  44.83 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1286  nucleoside diphosphate kinase  51.52 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  51.15 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  46.43 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0102  nucleoside diphosphate kinase  47.33 
 
 		 131 aa  137  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.874846  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0670  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0228  nucleoside-diphosphate kinase  48.46 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  47.1 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3326  nucleoside-diphosphate kinase  44.37 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  50.38 
 
 		 136 aa  136  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  49.24 
 
 		 133 aa  136  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2814  nucleoside diphosphate kinase  48.94 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  46.04 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  46.85 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  45.26 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  46.21 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  45.65 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  48.85 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  45.99 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  44.2 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  44.53 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  47.48 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  45.99 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  40.29 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  45.99 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  41.01 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  41.01 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  46.56 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3557  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3625  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0047  nucleoside diphosphate kinase  43.17 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  44.7 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>