More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0228 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0228  nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 133 aa  268  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  50.38 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 149 aa  151  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  53.03 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  51.13 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  52.31 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  54.76 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  52.38 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  53.49 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  51.54 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  49.24 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  51.15 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  53.6 
 
 		 138 aa  144  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  52.31 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  52.31 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  50.76 
 
 		 136 aa  144  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  51.91 
 
 		 149 aa  144  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  51.59 
 
 		 137 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  53.6 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  52.63 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  48.46 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  50.38 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  48.12 
 
 		 138 aa  141  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  51.2 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  49.21 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 136 aa  140  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00471  nucleoside diphosphate kinase  48.87 
 
 		 152 aa  139  9e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.602397  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00491  nucleoside diphosphate kinase  48.87 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  48.85 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  48.46 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  48.12 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0047  nucleoside diphosphate kinase  48.87 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  48.09 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  51.2 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0716  nucleoside diphosphate kinase  52.89 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000381443  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  48.09 
 
 		 149 aa  137  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  47.73 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  48.09 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0381  nucleoside-diphosphate kinase  48.46 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1286  nucleoside diphosphate kinase  50.77 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  48.41 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  52.42 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  46.46 
 
 		 143 aa  136  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00531  nucleoside diphosphate kinase  45.86 
 
 		 152 aa  136  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0670  nucleoside diphosphate kinase  50.77 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  47.2 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  47.69 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  49.23 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1390  nucleoside diphosphate kinase  51.54 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  48 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  47.69 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  48 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  47.33 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  46.83 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  47.93 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  48.87 
 
 		 138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  46.92 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  50.4 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  46.21 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  50.4 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  45.39 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  48.8 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  48.8 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  48.8 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  48.8 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  47.69 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0907  nucleoside-diphosphate kinase  46.62 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1295  nucleoside diphosphate kinase  48.09 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  48.8 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  46.03 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0684  Nucleoside-diphosphate kinase  47.73 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33705  normal  0.254357 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  45.8 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  47.33 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  47.93 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  45.38 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0038  nucleoside-diphosphate kinase  47.69 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  46.34 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  44.8 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>