More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0907 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0907  nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 
148 aa  297  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0381  nucleoside-diphosphate kinase  58.22 
 
 
147 aa  191  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0038  nucleoside-diphosphate kinase  54.79 
 
 
147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  49.64 
 
 
138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  51.43 
 
 
148 aa  161  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  48.55 
 
 
149 aa  153  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  50.37 
 
 
136 aa  152  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  48.55 
 
 
149 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  46.38 
 
 
149 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  51.13 
 
 
136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  52.63 
 
 
143 aa  150  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  50.72 
 
 
149 aa  148  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  50.72 
 
 
149 aa  148  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  48.55 
 
 
149 aa  147  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  47.01 
 
 
136 aa  148  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  47.1 
 
 
150 aa  147  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  47.14 
 
 
149 aa  147  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  47.1 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  46.43 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  46.53 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  45.26 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  48.55 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  45.27 
 
 
149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  45.8 
 
 
137 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 
135 aa  144  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  45.26 
 
 
149 aa  143  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  48.15 
 
 
136 aa  143  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  44.2 
 
 
149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  48.06 
 
 
140 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
149 aa  142  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  47.41 
 
 
136 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  44.29 
 
 
149 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  47.1 
 
 
149 aa  142  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
149 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1295  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 
140 aa  141  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  47.14 
 
 
154 aa  141  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  46.97 
 
 
134 aa  140  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  48.15 
 
 
138 aa  140  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  47.83 
 
 
149 aa  140  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  46.15 
 
 
141 aa  140  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1390  nucleoside diphosphate kinase  46.92 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
166 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  44.29 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  42.86 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  45.93 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  48.12 
 
 
136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1286  nucleoside diphosphate kinase  46.92 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3466  nucleoside diphosphate kinase  46.97 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  45.93 
 
 
138 aa  138  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  45.19 
 
 
149 aa  138  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
148 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  45.59 
 
 
141 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  43.85 
 
 
137 aa  138  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
148 aa  138  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  44.29 
 
 
159 aa  138  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2395  nucleoside diphosphate kinase  48.53 
 
 
139 aa  137  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0825331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  47.41 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0670  nucleoside diphosphate kinase  46.15 
 
 
139 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  44.36 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  44.2 
 
 
149 aa  137  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  45 
 
 
154 aa  137  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3326  nucleoside-diphosphate kinase  45.93 
 
 
144 aa  137  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  45.59 
 
 
137 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  48.12 
 
 
138 aa  136  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
147 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  41.3 
 
 
149 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
146 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  44.2 
 
 
148 aa  135  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2149  Nucleoside-diphosphate kinase  48.53 
 
 
137 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  45.93 
 
 
137 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
147 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  47.41 
 
 
140 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  45.93 
 
 
143 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  45.93 
 
 
137 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  45.19 
 
 
152 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0619  nucleoside-diphosphate kinase  48.55 
 
 
141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000154193  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  42.86 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  45.93 
 
 
142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  46.62 
 
 
136 aa  134  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 
147 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0102  nucleoside diphosphate kinase  43.85 
 
 
131 aa  134  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.874846  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3489  nucleoside diphosphate kinase  48.48 
 
 
141 aa  134  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  41.35 
 
 
143 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 
136 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  44.29 
 
 
160 aa  134  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  43.48 
 
 
151 aa  133  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1939  nucleoside diphosphate kinase  47.52 
 
 
143 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0228  nucleoside-diphosphate kinase  46.62 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  42.75 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  47.37 
 
 
136 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2227  nucleoside diphosphate kinase  47.52 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3868  nucleoside diphosphate kinase  46.97 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211598  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>