More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0038 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0038  nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 147 aa  299  8.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0381  nucleoside-diphosphate kinase  76.87 
 
 		 147 aa  240  3.9999999999999997e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0907  nucleoside-diphosphate kinase  54.79 
 
 		 148 aa  181  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  52.86 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  51.11 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  51.06 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  48.57 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  48.92 
 
 		 149 aa  153  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  47.22 
 
 		 151 aa  153  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  49.28 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  46.76 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  48.2 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  46.04 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  44.6 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  46.04 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  46.72 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  48.2 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  48.57 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  47.45 
 
 		 138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  48.91 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  47.14 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  45.83 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  43.17 
 
 		 149 aa  143  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  44.6 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  44.6 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  44.6 
 
 		 142 aa  143  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  47.45 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  44.6 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  44.6 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  44.6 
 
 		 151 aa  141  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  43.88 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  45.32 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  47.69 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  43.17 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  43.17 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  45.71 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0102  nucleoside diphosphate kinase  48.09 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.874846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  49.26 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3018  nucleoside diphosphate kinase  47.79 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  46.76 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  43.97 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2814  nucleoside diphosphate kinase  47.52 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1295  nucleoside diphosphate kinase  49.62 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1254  nucleoside diphosphate kinase  48.53 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  47.79 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  44.36 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  44.62 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  43.17 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  43.88 
 
 		 149 aa  137  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  46.51 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  43.17 
 
 		 148 aa  136  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  43.17 
 
 		 148 aa  136  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  46.04 
 
 		 152 aa  136  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  45.8 
 
 		 137 aa  136  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  47.41 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  45.65 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  44.93 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  47.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2802  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  42.45 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  47.41 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3326  nucleoside-diphosphate kinase  44.37 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  44.12 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  42.45 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  42.45 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  42.45 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  42.45 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  42.45 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  42.45 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  44.12 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  43.61 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  45.8 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2678  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  43.17 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  45.99 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  46.32 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2765  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2784  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2896  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  44.12 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2721  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1286  nucleoside diphosphate kinase  48.48 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  47.33 
 
 		 136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1390  nucleoside diphosphate kinase  48.48 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  44.6 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>