More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1600 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1600  ribose transport system permease protein rbsC  100 
 
 		 193 aa  362  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121047  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  98.96 
 
 		 311 aa  360  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  53.65 
 
 		 325 aa  192  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  48.98 
 
 		 314 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  49.48 
 
 		 318 aa  177  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  50 
 
 		 327 aa  171  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  48.97 
 
 		 311 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  49.48 
 
 		 327 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  49.19 
 
 		 309 aa  168  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  48.45 
 
 		 311 aa  167  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  48.44 
 
 		 322 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  47.94 
 
 		 311 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  47.94 
 
 		 311 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  47.42 
 
 		 311 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  47.42 
 
 		 311 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  47.42 
 
 		 311 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  47.42 
 
 		 311 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  47.42 
 
 		 311 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  47.42 
 
 		 311 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  47.42 
 
 		 311 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  47.03 
 
 		 306 aa  162  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  46.35 
 
 		 322 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  49.48 
 
 		 324 aa  158  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  47.92 
 
 		 321 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  47.92 
 
 		 321 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  47.92 
 
 		 321 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  47.92 
 
 		 321 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  47.92 
 
 		 321 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  46.7 
 
 		 337 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  43.88 
 
 		 350 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  46.15 
 
 		 335 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  44.56 
 
 		 337 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  44.56 
 
 		 337 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  44.56 
 
 		 337 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  44.56 
 
 		 337 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  44.72 
 
 		 324 aa  155  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  47.92 
 
 		 321 aa  154  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  47.92 
 
 		 321 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  46.88 
 
 		 322 aa  154  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  46.35 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  46.35 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  46.35 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  46.35 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  46.35 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  46.35 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  46.35 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  46.35 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  46.52 
 
 		 324 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  45.6 
 
 		 337 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 313 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  44.27 
 
 		 322 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  46.35 
 
 		 323 aa  151  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  46.15 
 
 		 333 aa  151  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 835 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  50.91 
 
 		 309 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  44.79 
 
 		 322 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  45.6 
 
 		 335 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  49.47 
 
 		 310 aa  148  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 314 aa  147  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  50.3 
 
 		 322 aa  145  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  40.84 
 
 		 310 aa  143  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  46.67 
 
 		 314 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 		 294 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  41.84 
 
 		 331 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  39.69 
 
 		 294 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  39.69 
 
 		 298 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.1 
 
 		 310 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2075  carbohydrate ABC transporter permease  40.1 
 
 		 279 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 		 349 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  42.86 
 
 		 312 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  40.1 
 
 		 310 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 343 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  44.38 
 
 		 330 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  44.38 
 
 		 330 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  44.38 
 
 		 330 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1909  carbohydrate ABC transporter permease  43.48 
 
 		 339 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.071894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1922  carbohydrate ABC transporter permease  43.48 
 
 		 339 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1196  ribose ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 		 334 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2071  ribose ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 		 341 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 		 345 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1640  carbohydrate ABC transporter permease  43.48 
 
 		 334 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.367254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0302  carbohydrate ABC transporter permease  43.48 
 
 		 334 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0470774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 343 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0858  carbohydrate ABC transporter permease  43.48 
 
 		 334 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  41.15 
 
 		 324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 		 334 aa  138  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 		 334 aa  138  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  42.16 
 
 		 326 aa  137  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 		 342 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  41.33 
 
 		 342 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  41.33 
 
 		 342 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  42.22 
 
 		 323 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  40.3 
 
 		 346 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  45 
 
 		 336 aa  135  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.42 
 
 		 334 aa  135  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  41.94 
 
 		 325 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  41.36 
 
 		 332 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2907  Monosaccharide-transporting ATPase  40.61 
 
 		 323 aa  134  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0357751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  39.42 
 
 		 342 aa  134  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>