26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0917 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  100 
 
 		 270 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  37.73 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  36.5 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  30.11 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  31.54 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  29.52 
 
 		 602 aa  119  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  29.52 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  28.95 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.46 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  26.62 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  27.56 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  31.87 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  26.2 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  26.52 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  27.31 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  26.37 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  43.44 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  25.68 
 
 		 540 aa  85.5  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  35.54 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  30.85 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  33.33 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  41.79 
 
 		 384 aa  72.4  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  47.54 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0296  hypothetical protein  42 
 
 		 398 aa  49.7  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.840944  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0774  hypothetical protein  33.87 
 
 		 554 aa  45.4  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.558269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0889  LicD family protein  54.55 
 
 		 373 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.207748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>