26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05870 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  100 
 
 		 284 aa  594  1e-169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  29.52 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  31.39 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  29.37 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  26.81 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  24.72 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  31.27 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  28.94 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.78 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  25.74 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  25.76 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  36.72 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  29.57 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  53.42 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  25 
 
 		 540 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  33.12 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  24.24 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  26.06 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  28.01 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  48.53 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  26.83 
 
 		 602 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  44.07 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  27.8 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0889  LicD family protein  51.22 
 
 		 373 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.207748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0774  hypothetical protein  45.76 
 
 		 554 aa  45.8  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.558269  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0296  hypothetical protein  43.24 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.840944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>