25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05940 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  100 
 
 		 290 aa  605  9.999999999999999e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  26.62 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  30.97 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  29.25 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  30.38 
 
 		 540 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  37.82 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  24.24 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  26.62 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  25.19 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.21 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  53.45 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  27.34 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  33.61 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  26.52 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  30.95 
 
 		 602 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  27.74 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  50.85 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  31.36 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  23.13 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  54.17 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  33.1 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  32.03 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  37.68 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0603  hypothetical protein  44.23 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000500963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1202  LicD family protein  35.71 
 
 		 427 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.673451  normal  0.966221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>