25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14490 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  100 
 
 		 540 aa  1132    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  30.38 
 
 		 290 aa  94.7  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  28.31 
 
 		 290 aa  92  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  26.69 
 
 		 266 aa  91.3  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  55.22 
 
 		 266 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  25.68 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  34.27 
 
 		 602 aa  82.4  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  38.39 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  25 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  37.01 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  26.05 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  23.84 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  59.62 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  50 
 
 		 286 aa  69.3  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  24.66 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.91 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  32.35 
 
 		 284 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  54.17 
 
 		 218 aa  66.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  54.35 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  39.33 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  50 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  36.36 
 
 		 384 aa  62  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  33.33 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0774  hypothetical protein  45.24 
 
 		 554 aa  44.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.558269  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0296  hypothetical protein  43.75 
 
 		 398 aa  43.9  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.840944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>