26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14540 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  100 
 
 		 602 aa  1255    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  34.73 
 
 		 307 aa  146  9e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  31.9 
 
 		 284 aa  130  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  29.52 
 
 		 270 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  30.04 
 
 		 266 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  28.67 
 
 		 281 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  28.8 
 
 		 290 aa  104  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  25.46 
 
 		 286 aa  96.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.74 
 
 		 274 aa  91.3  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  40.29 
 
 		 284 aa  91.3  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  27.89 
 
 		 261 aa  87.4  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  28.47 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  34.27 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  24.56 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  27.9 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  25.36 
 
 		 384 aa  76.6  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  27.5 
 
 		 266 aa  76.6  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  26.83 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  22.99 
 
 		 319 aa  73.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  30.95 
 
 		 290 aa  72  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  35.71 
 
 		 218 aa  69.3  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  24.81 
 
 		 273 aa  66.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  28.47 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0889  LicD family protein  33.82 
 
 		 373 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.207748 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0296  hypothetical protein  38.46 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.840944  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4996  hypothetical protein  30.56 
 
 		 404 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.910957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>