24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2440 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  100 
 
 		 273 aa  568  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  30.77 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.31 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  33.71 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  27.24 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  29.23 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  26.09 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  25.74 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  29.14 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  25.1 
 
 		 281 aa  85.5  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  35.54 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  35.16 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  30.38 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  28.87 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  26.52 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  51.67 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  24.81 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  34.78 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  24.81 
 
 		 602 aa  66.2  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  45.71 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  33.33 
 
 		 540 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  49.18 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  40.91 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1451  methyltransferase type 11  44.74 
 
 		 523 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.182574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>