23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2589 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  100 
 
 		 284 aa  577  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  41.3 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  30.29 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  33.71 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  26.2 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  27.08 
 
 		 307 aa  95.9  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  28.94 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  37.5 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  40.29 
 
 		 602 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  41.32 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  28.36 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  29.07 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  25.52 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  34.4 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  35 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  27.54 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  25.55 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  32.35 
 
 		 540 aa  66.6  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  44.74 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  33.1 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  35.11 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  37.66 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  28.68 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>