23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12330 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  100 
 
 		 322 aa  665    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  27.56 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  27.46 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  29.23 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  26.42 
 
 		 266 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  25 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  29.07 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  26.13 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  25.76 
 
 		 284 aa  86.7  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  23.08 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  28.47 
 
 		 602 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  37.01 
 
 		 540 aa  79  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  27.31 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.44 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  22.33 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  23.13 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  24.57 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  24.2 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  28.69 
 
 		 218 aa  55.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  42.42 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  46.67 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  40.98 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01048  mannosylphosphate transferase (Mnn4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12630)  30.21 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520838  normal  0.399913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>