23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0727 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  52.41 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  43.44 
 
 		 270 aa  89.4  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  34.51 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  38.14 
 
 		 274 aa  81.6  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  41.96 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  35 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  37.11 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  47.14 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  36.67 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  50.85 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  35.71 
 
 		 602 aa  69.3  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  34.78 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  54.17 
 
 		 540 aa  66.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  44.07 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  28.5 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  30.28 
 
 		 384 aa  65.9  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  43.1 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  44.44 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  31.03 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  28.69 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  48 
 
 		 338 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  40 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>