25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2033 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  100 
 
 
284 aa  588  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  49.29 
 
 
307 aa  296  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  41.07 
 
 
286 aa  221  8e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  37.45 
 
 
281 aa  203  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  31.9 
 
 
602 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  28.95 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  26.52 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  25 
 
 
322 aa  87.4  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  27.24 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  29.57 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  30.38 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  28.46 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  27.54 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  29.71 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  33.61 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  47.14 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  59.62 
 
 
540 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  50 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  47.62 
 
 
384 aa  69.3  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  50.75 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  26.74 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  41.03 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  47.76 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0296  hypothetical protein  38.46 
 
 
398 aa  46.2  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.840944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0889  LicD family protein  51.16 
 
 
373 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.207748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>