100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1451 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1451  methyltransferase type 11  100 
 
 		 523 aa  1033    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.182574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1175  LicD family protein  34.3 
 
 		 516 aa  203  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3212  coagulation factor 5/8 type-like  31.84 
 
 		 425 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0603  hypothetical protein  25.13 
 
 		 246 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000500963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0746  LicD family protein  31.25 
 
 		 539 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3213  hypothetical protein  27.27 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0774  hypothetical protein  32.62 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.558269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  42.05 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0889  LicD family protein  30.12 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.207748 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12360  LICD family protein  30.9 
 
 		 241 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5030  hypothetical protein  28.71 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4996  hypothetical protein  33.33 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.910957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  28 
 
 		 236 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0820  hypothetical protein  25.6 
 
 		 291 aa  53.9  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 206 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  28 
 
 		 236 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  28 
 
 		 236 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0890  LicD family protein  31.14 
 
 		 454 aa  53.5  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.147531 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  28 
 
 		 236 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 197 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 236 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 197 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 201 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 196 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  27 
 
 		 236 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2618  hypothetical protein  25.58 
 
 		 281 aa  52.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  28 
 
 		 222 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 208 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 195 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 262 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1202  LicD family protein  29.08 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.673451  normal  0.966221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1495  LicD family protein  31.1 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 208 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  37.6 
 
 		 227 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0316  Methyltransferase type 11  50.91 
 
 		 96 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  28 
 
 		 236 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  44.07 
 
 		 211 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  46.38 
 
 		 198 aa  50.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1461  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 283 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 220 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 209 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  47.37 
 
 		 198 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 199 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  27.13 
 
 		 195 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  50.94 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 226 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  26.14 
 
 		 287 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0463  hypothetical protein  25.52 
 
 		 244 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000202427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  42.47 
 
 		 226 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 212 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  30.6 
 
 		 280 aa  47  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  30.6 
 
 		 280 aa  47  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  37.31 
 
 		 248 aa  47  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1201  Methyltransferase type 12  35.11 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  41.07 
 
 		 212 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 246 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  36.21 
 
 		 200 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.22 
 
 		 253 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  27.33 
 
 		 512 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 262 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  39.73 
 
 		 254 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 277 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 200 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0296  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.840944  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 250 aa  45.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  44 
 
 		 243 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 247 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.94 
 
 		 253 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 211 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 262 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 210 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  36.36 
 
 		 196 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 241 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 210 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  37.29 
 
 		 198 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  34.12 
 
 		 223 aa  44.3  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0877  hypothetical protein  48.84 
 
 		 271 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 284 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  41.33 
 
 		 211 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  25.25 
 
 		 229 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 286 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 226 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  36 
 
 		 217 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  44.74 
 
 		 273 aa  43.9  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  37.1 
 
 		 209 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 206 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  36.25 
 
 		 213 aa  43.5  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2549  adenylylsulfate kinase  22.06 
 
 		 388 aa  43.9  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.064569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  41.56 
 
 		 266 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 225 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  34.58 
 
 		 197 aa  43.5  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  39.74 
 
 		 191 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 197 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 		 199 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 244 aa  43.5  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 214 aa  43.5  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4741  methyltransferase type 11  34.41 
 
 		 305 aa  43.5  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.168171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>