17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0296 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0296  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  802    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.840944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1495  LicD family protein  27.04 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5030  hypothetical protein  28.5 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0889  LicD family protein  33.33 
 
 		 373 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.207748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0890  LicD family protein  27.88 
 
 		 454 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.147531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0603  hypothetical protein  27.75 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000500963  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0463  hypothetical protein  27.31 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000202427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  42 
 
 		 270 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  38.46 
 
 		 602 aa  46.6  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1451  methyltransferase type 11  25 
 
 		 523 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.182574  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  38.46 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  46 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  43.24 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  29.41 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12360  LICD family protein  39.06 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  43.75 
 
 		 540 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0820  hypothetical protein  25.75 
 
 		 291 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.894594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>