21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0889 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0889  LicD family protein  100 
 
 		 373 aa  765    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.207748 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5030  hypothetical protein  35.14 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.840944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0890  LicD family protein  32.31 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.147531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1495  LicD family protein  34.94 
 
 		 454 aa  95.9  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1494  hypothetical protein  44.44 
 
 		 169 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1451  methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.182574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0603  hypothetical protein  27.75 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000500963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0820  hypothetical protein  31.28 
 
 		 291 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  27.5 
 
 		 512 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3212  coagulation factor 5/8 type-like  29.93 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0774  hypothetical protein  27.84 
 
 		 554 aa  54.3  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.558269  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4996  hypothetical protein  27.68 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.910957  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  33.82 
 
 		 602 aa  53.1  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0746  LicD family protein  31.55 
 
 		 539 aa  52.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1175  LicD family protein  26.18 
 
 		 516 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  51.22 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2618  hypothetical protein  25.33 
 
 		 281 aa  46.6  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  54.29 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  53.66 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  54.55 
 
 		 270 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>