More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00010 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00010  transporter, putative  100 
 
 
424 aa  868    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00030  conserved hypothetical protein  40.71 
 
 
599 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04109  MFS transporter Liz1/Seo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00980)  32.7 
 
 
505 aa  229  8e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05240  conserved hypothetical protein  32.49 
 
 
523 aa  225  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559352  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02663  conserved hypothetical protein  32.36 
 
 
472 aa  207  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08423  conserved hypothetical protein  31.73 
 
 
546 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03232  MFS pantothenate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00920)  35.9 
 
 
460 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35835  Pantothenate transporter FEN2 (Fenpropimorph resistance protein 2)  30.98 
 
 
462 aa  203  6e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29294  putative pantothenate transporter  29.6 
 
 
557 aa  176  7e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02321  MFS transporter Seo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01930)  28.5 
 
 
470 aa  173  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52466  putative permease, Suppressor of sulfoxyde ethionine Resistance Vitamin H transporter (H+/biotin symporter)  28.03 
 
 
580 aa  169  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.465437 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_11143  Suppressor of Sulfoxyde Ethionine resistance  28.07 
 
 
492 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.015921  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01880  transmembrane transporter Liz1p, putative  36.1 
 
 
493 aa  160  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02590  MFS transporter, putative  27.94 
 
 
512 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08936  conserved hypothetical protein  33.46 
 
 
465 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.57244  normal  0.266871 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01681  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00130)  28.26 
 
 
519 aa  149  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235626  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01850  MFS transporter, putative  25.88 
 
 
491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.278223  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10861  conserved hypothetical protein  28.64 
 
 
498 aa  146  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.424052  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04960  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 
533 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05810  nicotinamide mononucleotide permease, putative  26.13 
 
 
498 aa  143  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48956  Suppressor of Sulfoxyde Ethionine resistance  29.4 
 
 
552 aa  141  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.143446  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11116  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02730)  26.63 
 
 
489 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10075  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01812)  33.18 
 
 
541 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0433622 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02400  biotin transporter, putative  27.2 
 
 
498 aa  136  7.000000000000001e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00993  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11320)  27.27 
 
 
496 aa  136  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09000  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14670)  25.78 
 
 
499 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00260  hypothetical protein  27.84 
 
 
540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00951238  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07027  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04250)  33.08 
 
 
455 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00614  conserved hypothetical protein  31.54 
 
 
507 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252734  normal  0.815893 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05650  conserved hypothetical protein  25.18 
 
 
489 aa  129  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0116701  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06680  conserved hypothetical protein  24.81 
 
 
515 aa  129  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08502  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01370)  27.51 
 
 
503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0656476 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06381  conserved hypothetical protein  31.14 
 
 
349 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.426352  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02831  conserved hypothetical protein  29.31 
 
 
496 aa  126  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983705  normal  0.0394534 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02959  transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07950)  26.59 
 
 
565 aa  126  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374716 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01990  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 
534 aa  126  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08996  conserved hypothetical protein  30.8 
 
 
518 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00030  hypothetical protein  26.02 
 
 
505 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03221  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01000)  26.14 
 
 
510 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04129  hypothetical protein  26.86 
 
 
599 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451273  normal  0.0581011 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04106  conserved hypothetical protein  31.47 
 
 
562 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789789  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01110  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11820)  25.87 
 
 
493 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  0.983602 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51795  Suppressor of Sulfoxyde Ethionine resistance  25.31 
 
 
497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.289037 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00473  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16690)  30.33 
 
 
507 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_33997  allantoate permease  25.81 
 
 
539 aa  119  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3612  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.26 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65827  putative allantoate permease  27.17 
 
 
544 aa  117  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.429741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  28.15 
 
 
440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03066  conserved hypothetical protein  26.65 
 
 
537 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02344  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00710)  31.73 
 
 
493 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  28.74 
 
 
440 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06590  hypothetical protein  26.02 
 
 
494 aa  117  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219204  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61879  Transporter of Nicotinic Acid  22.66 
 
 
523 aa  116  6.9999999999999995e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.110717  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  27.86 
 
 
440 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  27.86 
 
 
440 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  27.07 
 
 
439 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02282  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06290)  28.78 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02030  conserved hypothetical protein  24.63 
 
 
527 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  28.31 
 
 
440 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05032  conserved hypothetical protein  23.38 
 
 
449 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_006686  CND04690  transporter, putative  30.2 
 
 
523 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  28 
 
 
432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  28.53 
 
 
436 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  26.4 
 
 
439 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  26.28 
 
 
454 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  27.85 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34802  putative permease  25.79 
 
 
553 aa  112  9e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0082411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  23.85 
 
 
440 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  27.27 
 
 
435 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09392  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04010)  28.95 
 
 
568 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  28.44 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  31.23 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10428  conserved hypothetical protein  23.8 
 
 
491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152123  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02800  tartrate transporter, putative  27.23 
 
 
530 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
444 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  31.09 
 
 
432 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02401  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
1010 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.666261  normal  0.0324765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 
440 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  26.04 
 
 
443 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  27.64 
 
 
435 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02880  High-affinity nicotinic acid transporter, putative  25.18 
 
 
508 aa  109  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 
445 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  25.78 
 
 
437 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  28.39 
 
 
428 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  25.95 
 
 
437 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05545  conserved hypothetical protein  27.96 
 
 
503 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11189  conserved hypothetical protein  28.4 
 
 
495 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0397486  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  29.91 
 
 
456 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60854  transporter of Nicotinic Acid  24.27 
 
 
507 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377771  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  23.99 
 
 
469 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03450  tartrate transporter, putative  25.54 
 
 
503 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.562433  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  26.17 
 
 
440 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  26.17 
 
 
440 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  26.17 
 
 
440 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  26.17 
 
 
440 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.17 
 
 
440 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  25.59 
 
 
436 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3103  major facilitator transporter  29.15 
 
 
435 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>