More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06220 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC06220  glycerate-and formate-dehydrogenase, putative  100 
 
 
344 aa  709    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00775  hydroxyisocaproate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14400)  40.68 
 
 
327 aa  206  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02850  2-hydroxyacid dehydrogenase, putative  41.09 
 
 
335 aa  186  7e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08130  2-hydroxyacid dehydrogenase, putative  40.65 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141601  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0758  Gluconate 2-dehydrogenase  43.67 
 
 
324 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163484  normal  0.223338 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05030  conserved hypothetical protein  34.17 
 
 
332 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.268578  normal  0.850236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1215  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  39.43 
 
 
324 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1043  2-hydroxyacid dehydrogenase  38.93 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.344903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  40.73 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05534  hypothetical D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase (Eurofung)  38.18 
 
 
339 aa  179  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00110553  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  42.04 
 
 
325 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  42.04 
 
 
325 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  42.04 
 
 
325 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2298  2-ketogluconate reductase  42.45 
 
 
325 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  42.62 
 
 
316 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26910  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  40.64 
 
 
329 aa  176  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0278379  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05660  oxidoreductase, putative  38.77 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.170759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13500  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  34.84 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1528  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.86 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31562  alpha-ketoisocaproate reductase or hydroxyisocaproate dehydrogenase  34.77 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0279947  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5027  gluconate 2-dehydrogenase  42.45 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19225 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  40.16 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1744  gluconate 2-dehydrogenase  41.63 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6348  gluconate 2-dehydrogenase  41.63 
 
 
321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1731  gluconate 2-dehydrogenase  41.63 
 
 
321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1652  gluconate 2-dehydrogenase  42.04 
 
 
321 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.999002  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  38.96 
 
 
317 aa  172  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  39.82 
 
 
322 aa  173  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  40.89 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1209  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  34.52 
 
 
325 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  38.4 
 
 
274 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2977  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  37.84 
 
 
328 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0936  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.26 
 
 
326 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  40.82 
 
 
341 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  37.76 
 
 
330 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000307425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.92 
 
 
529 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119542  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1652  gluconate 2-dehydrogenase  41.63 
 
 
321 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35320  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  37.84 
 
 
328 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317653  normal  0.274973 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  33.88 
 
 
320 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  40.72 
 
 
319 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.04 
 
 
319 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.04 
 
 
319 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  40.61 
 
 
327 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.2 
 
 
532 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2855  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.56 
 
 
345 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6845  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.18 
 
 
321 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2276  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40 
 
 
321 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  40 
 
 
328 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0692  Gluconate 2-dehydrogenase  44.75 
 
 
324 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.108341  normal  0.227497 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.34 
 
 
525 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01261  glyoxylate reductase  40.18 
 
 
357 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0511  glyoxylate reductase  38.65 
 
 
331 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  40.82 
 
 
340 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1815  glycolate reductase  41.13 
 
 
323 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.802319  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1982  putative 2-ketogluconate 6-phosphate reductase, TkrA  40 
 
 
321 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0969942 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.16 
 
 
524 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.04 
 
 
531 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1352  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.88 
 
 
534 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4462  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.3 
 
 
324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.88 
 
 
531 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  39.37 
 
 
322 aa  165  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3546  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.65 
 
 
531 aa  166  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4583  glyoxylate reductase  37.25 
 
 
332 aa  165  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.11 
 
 
524 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  34.41 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0128  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.09 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0232098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.4 
 
 
527 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  34.41 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.69 
 
 
531 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570425  hitchhiker  0.00544887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  34.3 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  39.16 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1261  2-hydroxyacid dehydrogenase  38.86 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829817  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_002950  PG2171  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  35.98 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4126  glyoxylate reductase  36.42 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2568  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.68 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00217021  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.45 
 
 
323 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  39.04 
 
 
331 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.25 
 
 
531 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0045  glycolate reductase  33.65 
 
 
333 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0516  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  33.96 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.11 
 
 
531 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  39.29 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30550  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  36.99 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3225  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.39 
 
 
531 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0639  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.78 
 
 
535 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.295873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  36.33 
 
 
339 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3376  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  38.27 
 
 
320 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.555118  normal  0.118844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.82 
 
 
531 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0616  glycolate reductase  34.62 
 
 
333 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164009  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  40 
 
 
327 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  36.76 
 
 
326 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  38.31 
 
 
334 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  36.76 
 
 
326 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2220  glycerate dehydrogenase  34.98 
 
 
323 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289915  decreased coverage  0.00653972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0073  putative glyoxylate reductase  37.65 
 
 
333 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.692518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0864  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.66 
 
 
324 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  35.77 
 
 
334 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.77 
 
 
531 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2382  gluconate 2-dehydrogenase  37.86 
 
 
320 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54026  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  33.87 
 
 
332 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>