59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1411 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1411  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  100 
 
 		 382 aa  779    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.202691  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1544  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.76 
 
 		 374 aa  179  8e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0080  restriction modification system DNA specificity subunit  35.41 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3471  restriction modification system DNA specificity domain protein  37.58 
 
 		 419 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3055  restriction modification system DNA specificity subunit  37.46 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.363566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4394  restriction modification system DNA specificity subunit  34 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.536192  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2272  type I restriction system specificity protein  30.81 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0816  restriction modification system DNA specificity subunit  36.76 
 
 		 267 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2423  restriction modification system DNA specificity subunit  29.12 
 
 		 426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  35.71 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1842  restriction modification system DNA specificity subunit  31.22 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  30 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1500  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.88 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.100633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2180  restriction modification system DNA specificity subunit  28.34 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1106  restriction modification system DNA specificity subunit  31.41 
 
 		 161 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3351  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  30.99 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00146581  normal  0.0102246 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.97 
 
 		 1134 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1105  restriction modification system DNA specificity subunit  28.51 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1851  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  40.22 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1890  type I restriction-modification system, S subunit  31.54 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  28.67 
 
 		 775 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0107  type I restriction modification DNA specificity family protein  45.59 
 
 		 85 aa  66.2  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.517925  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  26.04 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  25.44 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.79 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  25.48 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  23.37 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  25.37 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0446  restriction modification system DNA specificity subunit  28.57 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000807768  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3352  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  25.45 
 
 		 303 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000513186  normal  0.0100815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  22.47 
 
 		 351 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1435  restriction modification system DNA specificity subunit  22.15 
 
 		 340 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.68 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0040  restriction-modification enzyme subunit s3a  23.74 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0522579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.78 
 
 		 442 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0227  restriction modification system DNA specificity domain  24.14 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0038  reStriction-modification enzyme mpuuiii s subunit  31.31 
 
 		 129 aa  50.1  0.00006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.314064  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0039  restriction modification enzyme subunit s2a  26.9 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.286147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2743  type I restriction-modification system, S subunit, truncation  25 
 
 		 175 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.441032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0369  N-6 DNA methylase  19.92 
 
 		 764 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  23.71 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0899  restriction endonuclease S subunit  23.81 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681459  hitchhiker  0.00000169581 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  26.23 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  22.09 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4810  putative type I restriction-modification system specificity subunit  22.45 
 
 		 360 aa  47.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  22.8 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  26.14 
 
 		 1285 aa  47  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0041  restriction-modification enzyme subunit s3b  28.46 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.370047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  25.74 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.61 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1094  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.81 
 
 		 205 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0782363  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  22.52 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  24.09 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  23.95 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  25.71 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  21.79 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  22.88 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  27.08 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>