More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04845 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04845  oligopeptide ABC transporter permease  100 
 
 
368 aa  735    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.16 
 
 
381 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.78 
 
 
363 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.29649 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2180  oligopeptide ABC transporter, permease  42.72 
 
 
412 aa  288  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0605837  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
307 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
497 aa  213  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
495 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  48.42 
 
 
288 aa  205  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
496 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
494 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  44.59 
 
 
479 aa  203  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.36 
 
 
301 aa  203  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.53 
 
 
287 aa  203  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.73 
 
 
304 aa  203  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
485 aa  202  6e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.79 
 
 
284 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.7 
 
 
280 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.95 
 
 
280 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  43.56 
 
 
473 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 
285 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.95 
 
 
274 aa  199  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 
285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  44.18 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
309 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
318 aa  194  3e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
282 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.31 
 
 
309 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  45.87 
 
 
299 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  45.87 
 
 
299 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  45.87 
 
 
299 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  45.87 
 
 
299 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  45.87 
 
 
299 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  46.43 
 
 
301 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
364 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  47.95 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
296 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
280 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.41 
 
 
293 aa  189  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
379 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.73 
 
 
310 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
379 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.750131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
340 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
359 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
867 aa  186  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.2 
 
 
325 aa  186  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
363 aa  185  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.960083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 
295 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  41.42 
 
 
279 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  45.54 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1479  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppC  34.4 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.230564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 
310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1403  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  32.63 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
293 aa  182  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
345 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
312 aa  182  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2680  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.64 
 
 
290 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129024  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.84 
 
 
293 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
305 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429723  normal  0.768739 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  40.49 
 
 
282 aa  182  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
353 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.28935  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  45.7 
 
 
300 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.7 
 
 
300 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
284 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
299 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
469 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
289 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 
310 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.37 
 
 
302 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2265  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.65 
 
 
302 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0825509  normal  0.518355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2030  ABC transporter, permease protein  43.67 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.749678 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
301 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
278 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
273 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.609485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2574  peptide ABC transporter, permease protein  45.12 
 
 
302 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
302 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.95 
 
 
542 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
377 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
299 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
338 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  39.11 
 
 
283 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  39.11 
 
 
283 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  39.11 
 
 
283 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.11 
 
 
283 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 
310 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.361284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
283 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4106  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
338 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
347 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435279  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.05 
 
 
300 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0620007  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
338 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0104198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.11 
 
 
283 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>