More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6727 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
270 aa  510  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  510  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3839  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
252 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5289  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.32 
 
 
252 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293158  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
294 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
258 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
267 aa  133  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
265 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
261 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
261 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
258 aa  122  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
261 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
262 aa  122  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
266 aa  121  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  31.2 
 
 
255 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
263 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
262 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 
255 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
262 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.4 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.68 
 
 
247 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.4 
 
 
246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.54 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  30.52 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  29.88 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
261 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
254 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
241 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.35 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.94 
 
 
247 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
258 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  30.28 
 
 
255 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
266 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.47 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.8 
 
 
247 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1221  ketoacyl reductase  33.59 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209308  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  30 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  27.73 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
234 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
261 aa  109  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
254 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
254 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0610  putative short-chain dehydrogenase/reductase  31.6 
 
 
286 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0678259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
265 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07435  putative short-chain dehydrogenase/reductase  30.71 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.492431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.94 
 
 
246 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 
246 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.43 
 
 
250 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.43 
 
 
250 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  29.2 
 
 
255 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
249 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128748  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 
246 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 
246 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
262 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
282 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.451543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
257 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1391  NAD/NADP dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
261 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
255 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
255 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
255 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  30 
 
 
256 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
246 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
266 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
263 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.50771  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
280 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 
253 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.95 
 
 
246 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 
253 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5249  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 
318 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109132  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  30.31 
 
 
254 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
258 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
249 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
254 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
255 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.556744  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
249 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
258 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.75 
 
 
257 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
257 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>