More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4057 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
277 aa  542  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.89 
 
 
278 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 
301 aa  258  9e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  46.3 
 
 
315 aa  255  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.89 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.0135011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03900  carbohydrate ABC transporter membrane protein  46.47 
 
 
302 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.232057 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.24 
 
 
300 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0577921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06570  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.6 
 
 
322 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  44.78 
 
 
307 aa  230  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0927  MalG-type ABC sugar transport systems permease component  41.54 
 
 
335 aa  229  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0503767  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17040  carbohydrate ABC transporter membrane protein  47.31 
 
 
299 aa  229  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.11 
 
 
286 aa  227  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1006  MalG-type ABC sugar transport system permease component  40.81 
 
 
335 aa  226  4e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.88 
 
 
309 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0132992  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
283 aa  222  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.267777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
301 aa  221  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.25 
 
 
280 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0242548  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.81 
 
 
297 aa  216  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
276 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.136285  normal  0.16361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
301 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257008  normal  0.121163 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1764  MalG-type ABC sugar transport system permease component  42.26 
 
 
316 aa  206  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.335496  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  36.53 
 
 
278 aa  166  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.32 
 
 
302 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  36.08 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 
269 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482882  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.28 
 
 
311 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  35.96 
 
 
290 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
275 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
324 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  34.18 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4881  monosaccharide-transporting ATPase  36.06 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196924  normal  0.0342078 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  32.47 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
275 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  37.25 
 
 
278 aa  139  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
290 aa  138  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  37.25 
 
 
278 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
283 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
269 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573578  normal  0.782231 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
270 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
270 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
295 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
278 aa  135  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
269 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  32.21 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
268 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 
297 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
277 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603353  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
271 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
277 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0410  Monosaccharide-transporting ATPase  32 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  31.32 
 
 
292 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  32.08 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0166625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
278 aa  129  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
294 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  31.98 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  34.13 
 
 
297 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  31.82 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
275 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  27.04 
 
 
276 aa  126  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
297 aa  125  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
296 aa  125  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
294 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
280 aa  125  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  29.59 
 
 
277 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.81 
 
 
304 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 
277 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
297 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
272 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.691915  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
296 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
297 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  30.47 
 
 
277 aa  123  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.47 
 
 
307 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.050978  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.22 
 
 
279 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
324 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
298 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
301 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
275 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.52 
 
 
350 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
390 aa  122  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
270 aa  122  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7591  ABC transporter membrane spanning protein  30.5 
 
 
275 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>