More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_04020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
307 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03900  carbohydrate ABC transporter membrane protein  67.76 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.232057 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.82 
 
 
276 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.136285  normal  0.16361 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17040  carbohydrate ABC transporter membrane protein  60.62 
 
 
299 aa  334  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.7 
 
 
301 aa  297  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257008  normal  0.121163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.36 
 
 
278 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.14 
 
 
313 aa  281  9e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.0135011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  44.44 
 
 
315 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
301 aa  259  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.12 
 
 
283 aa  257  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.267777  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.55 
 
 
300 aa  256  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0577921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06570  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.86 
 
 
322 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.8 
 
 
309 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0132992  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0927  MalG-type ABC sugar transport systems permease component  43.94 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0503767  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1006  MalG-type ABC sugar transport system permease component  45.82 
 
 
335 aa  245  6e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541487  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 
286 aa  235  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.91 
 
 
280 aa  232  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0242548  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 
297 aa  231  8.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.79 
 
 
277 aa  228  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1764  MalG-type ABC sugar transport system permease component  40.51 
 
 
316 aa  203  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.335496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
316 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482882  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  39.66 
 
 
278 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  37.68 
 
 
278 aa  163  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
268 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
289 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
290 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
269 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573578  normal  0.782231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4881  monosaccharide-transporting ATPase  32.47 
 
 
269 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196924  normal  0.0342078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  31.36 
 
 
290 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
300 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  34.93 
 
 
295 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
277 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 
277 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
281 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
276 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 
276 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  32.59 
 
 
294 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.11 
 
 
297 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
311 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
297 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.807172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.46 
 
 
306 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
283 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
299 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1703  putative transport system permease ABC transporter protein  29.6 
 
 
292 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.757038  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  28.94 
 
 
306 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
289 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00195134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
296 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
291 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0974901  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  33.7 
 
 
292 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
269 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
298 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
292 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
295 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0166625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
292 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521844  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.250656  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.23 
 
 
296 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  35.21 
 
 
278 aa  136  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.99 
 
 
302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  32.13 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  34.78 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.82 
 
 
299 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
281 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
290 aa  135  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
308 aa  135  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18870  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.86 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  34.22 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.21 
 
 
304 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  34.86 
 
 
278 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
324 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  30.94 
 
 
269 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.14 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
298 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5822  putative sugar uptake ABC transporter permease protein  32.57 
 
 
298 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0410  Monosaccharide-transporting ATPase  30.82 
 
 
288 aa  133  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
315 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.48 
 
 
279 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
281 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
299 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
246 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.08 
 
 
350 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.32 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  30.47 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273783  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.87 
 
 
277 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>