More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1461 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1482  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  98.19 
 
 
386 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328933  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1560  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  91.73 
 
 
387 aa  683    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1461  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  100 
 
 
387 aa  779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4702  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  92.51 
 
 
387 aa  690    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1536  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  91.21 
 
 
387 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1672  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  89.84 
 
 
382 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.949523  normal  0.128117 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1080  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  91.73 
 
 
387 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1244  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  76.98 
 
 
380 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.877663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1985  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  76.98 
 
 
380 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1816  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  76.98 
 
 
380 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.521456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0775  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  76.98 
 
 
391 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1729  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  76.98 
 
 
391 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1833  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  76.98 
 
 
380 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0387  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  76.98 
 
 
391 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2504  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  75.39 
 
 
380 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2495  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  67.92 
 
 
376 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1742  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  66.93 
 
 
374 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1652  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  67.77 
 
 
376 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49047  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  50.52 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  50.27 
 
 
383 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  49.48 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  50.68 
 
 
360 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  48.84 
 
 
376 aa  296  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2431  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.85 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.843563  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.16 
 
 
370 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 
350 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.45 
 
 
355 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.7 
 
 
356 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.19 
 
 
368 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.33 
 
 
356 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.62 
 
 
357 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  41.34 
 
 
357 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2744  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45 
 
 
370 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.662947  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2556  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.65 
 
 
363 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2998  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.85 
 
 
363 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246474  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2006  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.32 
 
 
375 aa  246  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3378  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.11 
 
 
363 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1252  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.39 
 
 
363 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0971666  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3571  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.28 
 
 
346 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.92 
 
 
383 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.92 
 
 
383 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
376 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2139  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.16 
 
 
380 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000311215  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  41.46 
 
 
365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.29 
 
 
363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.79 
 
 
383 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3591  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.22 
 
 
345 aa  232  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.79 
 
 
365 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
379 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
379 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.96 
 
 
351 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.67 
 
 
351 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 
379 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.82 
 
 
379 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.47 
 
 
350 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.06 
 
 
382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.38 
 
 
351 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0950  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
376 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.133891  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
379 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.81 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1798  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.9 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.12 
 
 
356 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  35.63 
 
 
352 aa  220  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.1 
 
 
351 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.34 
 
 
379 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.34 
 
 
379 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.1 
 
 
351 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.37 
 
 
376 aa  219  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.668457  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  35.45 
 
 
352 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.52 
 
 
351 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.38 
 
 
350 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1607  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.16 
 
 
390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0831  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.11 
 
 
382 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2183  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.11 
 
 
382 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0923  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.11 
 
 
382 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.81 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.81 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 
346 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44511  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.34 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01706  enoyl-CoA hydratase  37.27 
 
 
390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.676708  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.75 
 
 
357 aa  213  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.42 
 
 
344 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 
356 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.45 
 
 
360 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.32 
 
 
358 aa  210  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.78 
 
 
344 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0601175  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 
352 aa  208  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.06 
 
 
353 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2130  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
361 aa  206  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0313318  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
348 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.1 
 
 
357 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38 
 
 
350 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0903  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 
350 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.55 
 
 
335 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130817  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3165  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.24 
 
 
334 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1527  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 
334 aa  202  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6082  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.18 
 
 
335 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.92 
 
 
357 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>