More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3491 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  100 
 
 
357 aa  724    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  98.6 
 
 
357 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  93.28 
 
 
356 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  87.68 
 
 
356 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.21 
 
 
368 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  67.14 
 
 
365 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.76 
 
 
365 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.24 
 
 
360 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.3 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.82 
 
 
363 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.42 
 
 
370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.77 
 
 
350 aa  308  6.999999999999999e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.07 
 
 
376 aa  298  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.69 
 
 
383 aa  282  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 
346 aa  278  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.27 
 
 
383 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  46.41 
 
 
376 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3591  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.66 
 
 
345 aa  272  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.78 
 
 
350 aa  269  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.61 
 
 
414 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.38 
 
 
369 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  46.18 
 
 
360 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.21 
 
 
350 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.1 
 
 
351 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.1 
 
 
351 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.08 
 
 
351 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.08 
 
 
351 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2744  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.35 
 
 
370 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.662947  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.82 
 
 
351 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2495  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.89 
 
 
376 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.82 
 
 
351 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.51 
 
 
351 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3571  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 
429 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 
383 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.24 
 
 
351 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 
383 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 
379 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.13 
 
 
379 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.96 
 
 
351 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2183  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.17 
 
 
382 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0831  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.17 
 
 
382 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0923  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.38 
 
 
382 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451836  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
353 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
379 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.36 
 
 
379 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.36 
 
 
379 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.36 
 
 
379 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1252  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.61 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0971666  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.83 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2556  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.61 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1798  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.94 
 
 
380 aa  252  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1652  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.94 
 
 
376 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49047  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0387  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.9 
 
 
391 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1833  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.23 
 
 
380 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1244  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.9 
 
 
380 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.877663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0775  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.9 
 
 
391 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1985  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.9 
 
 
380 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1729  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.9 
 
 
391 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1816  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.9 
 
 
380 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.521456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05575  putative enoyl-coenzyme A hydratase protein  42.82 
 
 
390 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1742  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.33 
 
 
374 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.57 
 
 
382 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.35 
 
 
344 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  35.45 
 
 
352 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  36.21 
 
 
352 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2431  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.55 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.843563  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.18 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.75 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.97 
 
 
352 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.1 
 
 
357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.07 
 
 
360 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3165  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 
334 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4702  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.14 
 
 
387 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.11 
 
 
353 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2998  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.07 
 
 
363 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246474  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.01 
 
 
379 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3378  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.86 
 
 
363 aa  235  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.68 
 
 
357 aa  235  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.52 
 
 
357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.42 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1461  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.34 
 
 
387 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.12 
 
 
350 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1379  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.07 
 
 
368 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1482  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.23 
 
 
386 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328933  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2504  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.47 
 
 
380 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2593  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
382 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000406118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1607  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.26 
 
 
390 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2139  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.09 
 
 
380 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000311215  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2767  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
383 aa  229  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1373  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 
367 aa  229  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.502408  normal  0.0715263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1527  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.92 
 
 
334 aa  229  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1681  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.94 
 
 
383 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2472  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
369 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0119935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5645  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.84 
 
 
382 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789263  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0649  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
354 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0753828  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.35 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2130  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 
361 aa  225  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0313318  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 
383 aa  225  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0893732  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.45 
 
 
383 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0631  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.5 
 
 
359 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>