More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2472 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2472  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
369 aa  744    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0119935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.39 
 
 
371 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0222  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.72 
 
 
391 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01706  enoyl-CoA hydratase  53.03 
 
 
390 aa  341  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.676708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2130  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.74 
 
 
361 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0313318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1607  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.54 
 
 
390 aa  316  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1681  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  47.44 
 
 
383 aa  315  8e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2767  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.71 
 
 
383 aa  315  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.17 
 
 
383 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0893732  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2593  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.44 
 
 
382 aa  309  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000406118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.44 
 
 
383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1373  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.81 
 
 
367 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.502408  normal  0.0715263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1499  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.17 
 
 
383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.74062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1493  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.17 
 
 
383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.17 
 
 
383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.04 
 
 
367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0415328  hitchhiker  0.0000113025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.63 
 
 
389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1671  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.18 
 
 
376 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.819283  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4398  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.16 
 
 
368 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.77 
 
 
367 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1053  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.18 
 
 
368 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.6 
 
 
368 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1412  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.6 
 
 
368 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78202  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.08 
 
 
413 aa  293  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.96 
 
 
414 aa  292  7e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2064  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.46 
 
 
367 aa  292  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1348  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.78 
 
 
370 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18532  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1379  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  47.89 
 
 
368 aa  288  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0656  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.91 
 
 
368 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1477  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.32 
 
 
386 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.748261  normal  0.0218016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.19 
 
 
376 aa  285  9e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.668457  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1342  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.01 
 
 
372 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2779  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.19 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.701645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1939  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 
374 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1082  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.26 
 
 
423 aa  281  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0950  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.12 
 
 
376 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.133891  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.19 
 
 
427 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000371  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  38.98 
 
 
394 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3198  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.59 
 
 
381 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  hitchhiker  0.0056417 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.59 
 
 
374 aa  265  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1594  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.63 
 
 
375 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001549  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  40.59 
 
 
379 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3652  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.35 
 
 
369 aa  259  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.26 
 
 
368 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.61 
 
 
360 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  39.6 
 
 
357 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.89 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.89 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.33 
 
 
370 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.06 
 
 
356 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 
346 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 
355 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.38 
 
 
351 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.55 
 
 
376 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.01 
 
 
351 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.01 
 
 
351 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.55 
 
 
351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.19 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.1 
 
 
351 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.73 
 
 
351 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 
344 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.01 
 
 
351 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.01 
 
 
351 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.83 
 
 
350 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.01 
 
 
351 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1788  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 
343 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149813  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0155  enoyl-CoA hydratase  40.82 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.83 
 
 
352 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.43 
 
 
350 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
350 aa  219  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2121  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.42 
 
 
357 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406084  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.71 
 
 
357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.9 
 
 
414 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.29 
 
 
350 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1252  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.01 
 
 
363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0971666  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.47 
 
 
348 aa  216  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2556  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.46 
 
 
363 aa  215  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.13 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.55 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2431  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.75 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.843563  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.43 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.06 
 
 
356 aa  212  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.43 
 
 
379 aa  212  7e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.56 
 
 
379 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.42 
 
 
347 aa  212  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
379 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.48 
 
 
360 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.42 
 
 
357 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.65 
 
 
356 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.82 
 
 
352 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
379 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0229  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40 
 
 
350 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.06 
 
 
369 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.07 
 
 
353 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3300  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.3 
 
 
357 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.44 
 
 
383 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3591  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.23 
 
 
345 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.01 
 
 
379 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0903  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.42 
 
 
350 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>